酵母提取rna步骤有什么不足?

??TRIzon是广谱型总RNA提取试剂。实验操作快速方便,颜色鲜明,便于分层。本试剂适用范围广泛,可以从动物组织、植物材料、各种微生物及培养细胞等样品中提取总RNA。样品在TRIzon中被充分裂解的同时能够*限度地保证RNA的完整性。在加入氯仿离心后,溶液会分成三层:上层无色水相、中间层和下层红色有机相,RNA分布在上清层中。收集上清层后,经异丙醇沉淀便可以回收得到总RNA。提取的总RNA完整性好,无蛋白和DNA污染,可用于各种分子生物学常规实验,如RT-PCR、Real-time

TRIzon试剂(总RNA提取)实验前准备及重要注意事项:
1、预防RNase污染,应注意以下几方面:
1)使用无RNase的塑料制品和枪头,避免交叉污染。
2)玻璃器皿应在使用前于180℃高温下干烤4小时,塑料器皿可在0.5M的NaOH中浸泡10分钟,用水彻底冲洗后高压灭菌。
3)配制溶液应使用无RNase的水。
4)操作人员戴一次性口罩和手套,实验过程中要勤换手套。
2、提取的样品避免反复冻融,否则影响RNA提取得率和质量。
3、本品中含有苯酚,具有毒性和腐蚀性。如果吸入体内、接触皮肤、吞食等会导致中毒、灼伤以及其他身体伤害。使用本制品时应穿戴防护物品,如防护服装、手套、眼罩、面罩等。如果不小心接触到眼睛,应立即用大量的水冲洗并前往医院治疗
4、样品用TRIzon 匀浆后,如不即刻加入氯仿,置于-70℃下可放置一个月以上。
5、保存在75%乙醇中的RNA沉淀,2~8℃可以保存一周,-20℃条件下可以保存1年。RNA半衰期比较短,容易降解,建议提取后尽快进行后续实验,如反转录成cDNA,Northern Blot等。

1a.植物组织:取新鲜植物组织在液氮中充分研磨或将植物组织剪碎后直接在TRIzon中迅速研磨,每30-50 mg组织加入1ml TRIzon,混匀。
注意:样品体积一般不要超过TRIzon体积的10%。
1b.动物组织:取新鲜或-70℃冻存的动物组织尽量剪碎,每30-50 mg组织加入1ml的TRIzon,匀浆仪进行匀浆处理。或在液氮中研磨后加入TRIzon 1ml混匀。
注意:样品体积一般不要超过TRIzon体积的10%。
1c.单层培养细胞:吸去培养液,可直接在培养板中加入适量TRIzon(每10cm2面积需要1ml TRIzon),用取样器反复吹打使细胞裂解。也可用胰蛋白酶处理后,将细胞溶液转移至RNase-Free的离心管中,300×g离心5 min,收集细胞沉淀,仔细吸除所有上清,加入TRIzon 1ml混匀。
1)收集细胞数量不要超过1×107。
2)TRNzol加量根据培养板面积决定,不是由细胞数决定。如果TRIzon加量不足,可能导致提取的RNA中有DNA污染。
3)收集细胞时一定要将细胞培养液去除干净,否则会导致裂解不完全,造成RNA的产量降低。
1d.细胞悬液:离心收集细胞。每5×106-1×107动物、植物和酵母细胞或每107细菌细胞加入1ml TRIzon。
1)加入TRIzon前不要洗涤细胞,以免RNA降解。
2)一些酵母和细菌细胞可能需要匀浆仪或液氮研磨处理。
1f.可选步骤:对于蛋白、脂肪、多糖或胞外物质含量高的样品,如肌肉组织、脂肪组织或植物的块茎,可以在匀浆处理后4℃,12000rpm(~~13400×g)离心10分钟以除去不溶物质,此时沉淀中含胞外物质、多糖和高分子量的DNA,而RNA存在于上清中。

2、样品中加入TRIzon后反复吹打几次,使样本充分裂解。室温放置5分钟,使蛋白核酸复合物完全分离。
3、向以上溶液中加入氯仿,每使用1ml TRIzon加入0.2ml氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15秒,室温放置2-3分钟。
4、4℃下12000rpm离心15分钟,此时样品分成三层:红色有机相,中间层和上层无色水相,RNA 主要在水相中,把水相(约600μl)转移到一个新的RNase-Free离心管(自备)中。
5、在得到的水相溶液中加入等体积异丙醇,颠倒混匀,室温放置10分钟。
7、加入75%乙醇(用无RNase的水配制)洗涤沉淀。每使用1ml TRIzon用1ml 75%乙醇对沉淀进行洗涤。
8、4℃ 12000rpm离心3分钟,小心吸弃上清,注意不要吸弃RNA沉淀。
注意:剩余的少量液体可短暂离心,然后用枪头吸出,注意不要吸弃沉淀。
9、室温放置2-3分钟,晾干。加入30-100μl无RNase的水,充分溶解RNA,得到的RNA保存在-70℃,防止降解。
注意:沉淀不要过分干燥,以免难于溶解。

储存条件:2~8℃避光。

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酵母RNA提取试剂盒性质、用途与生产工艺

本试剂盒适用于酵母RNA的提取,酵母细胞经溶壁酶处理去除细胞壁后,独特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶,然后用乙醇调节结合条件后,RNA选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的RNase free H20将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。

酵母细胞经Lytic Enzyme处理去除细胞壁后,独特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶,然后用乙醇调节结合条件后,总RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的去蛋白、漂洗的步骤将细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的RNase Free H2O将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。
一般来说,酵母细胞样本量为2×108时,可提取的RNA量为30-100 μg,A260/A280的值在1.8-2.0之间,可满足下游实验应用。该产品可在50 min内完成样品RNA的提取,提取的总RNA完整性好,无蛋白和基因组DNA污染。

1.不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
2.快速,简捷,单个样品裂解后操作一般可在30分钟内完成。

  • 裂解液RLT和去蛋白液RW1中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
  • 操作前在裂解液RLT中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1 mL RLT中加入10 μL β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的RLT 4℃可放置一个月。
  • 吸取使用量的缓冲液SE加入0.2% β-巯基乙醇备用

酵母RNA提取试剂盒 上下游产品信息


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一、用Trizol 抽提的RNA,用糖凝胶电泳,出现许多条带(至少四条以上),是哪些原因导致的?


1、是从组织里抽的还是细胞抽的?组织的RNA电泳不理想,但目的条带仍能跑出来。细胞的电泳相当漂亮,但有时逆转录效果反而不好。组织经常出现这种情况,组织抽提的RNA不纯,而且多多少少有降解。不过下一步可以接着做逆转录,可能对后面的实验影响不会很大。


2、是mRNA的话,这样的效果挺不错的。如果是总RNA,那是降解了。不过细胞的RNA应该不容易降解,可以上样少点再跑胶。


3、可以试试在70度5分钟,然后再跑跑电泳可能有意想不到的结果。


4、建再进行RNA精致的过程,也就是Trizol后,加氯仿,吸取上清尽量少吸,然后将其再按规程离心一次吸取上清后加入异丙醇,然后再用70%冰乙醇洗两次可见RNA,如果还是不行的话最好用柱式吸附柱将上清与70%冰乙醇混合后过柱怀疑这种属于基因组DNA污染在操作过和的preeogress降解.所以一定要按规程进行抽提。

二、胰腺组织RNA提取时在研磨时总是粘在研钵,怎么处理?有什么好的方法吗?

取出胰腺组织后立刻浸入液氮中,然后将其转移至研钵中(研钵要经180度干烤4-8小时,除去RNAase),持续研磨,一边研磨一边加液氮,研磨成粉末。此时要注意液氮的补充,如果组织化开就会出现组织粘在研钵内的情况。 研磨成粉末后加入Trizol,此时,由于低温Trizol也会冻住,持续研磨至Trizol化开并澄清亮,就可以了。然后离心,进行下面的步骤。也可以使用匀浆器,很便宜,也很简单。当然要经去处RNAase处理。在冰上将组织研磨成匀浆即可。

三、所有的准备工作如干烤、DEPC浸泡等均按分子克隆上说的处理了,可是就是提取不出RNA来。异丙醇沉淀后在管底也有乳白色的东西,用DEPC水溶解却溶解不了,很粘稠。电泳什么也看不见。用的组织是小鼠的肺和脾脏,TRIZOL用的是GIBCOL的。组织和TRIZOL的比例为每50mg用1ml TRIZOL。为什么?

乳白色的东西有可能就是RNA,一定要溶解,实在不行就在70%乙醇洗过后迅速空气一下,加DEPC水,还溶解不了就65度加热10分钟.好象100mg组织加1mlTRIZOL足够了。

四、提取酵母的总RNA都用什么方法?有好用的盒吗?酵母总RNA提取应该注意什么?

使用热酚法抽提酵母RNA,很好用。


1、 将酵母细胞在3ml选择性中,30℃过夜旋转培养。


2、 稀释过夜培养的菌液,重新在10ml培养基中培养细胞。


5、 ?加入1/10体积的10% SDS,充分混合。 加入等体积在65℃预热的酸性酚(pH4.5),混合。


9、 加入1/10体积3M pH5.2的醋酸钠,2.5倍体积的纯乙醇,-20℃过夜沉淀。


10、 沉淀样品于4℃离心5min,去除液体。


11、 在冰上干燥RNA(放置15min),最后用适量DEPC水溶解RNA。

五、贴壁细胞消化后可不可以离心后加入Trizol呢?有影响吗?

可以,用少量PBs重悬,然后用trizol提取,不过提取要快,不能存放,因为细胞为活体,表达受外界环境影响,要是已经存放了两小时,建议重做。

六、在没有液氮的条件下,直接研磨组织成粉末再加入TRizol中,对RNA提取的质量会不会影响很大?或者在研磨过程中直接加入TRizol研磨直到成粉末,这样可不可取?

在没有液氮的条件下,直接研磨组织成粉末再加入TRizol中,这样RNA早就没有了。


要是在研磨过程中直接加入TRizol研磨直到成粉末,可以观察组织,看研磨得什么样子了,磨的差不多时加trizol,可试一下,镜下观察然后确定加入trizol试剂。

七、冻存细胞与新鲜细胞的RNA提取有区别吗?具体该怎么操作?

新鲜细胞与冻存细胞RNA提取没什么区别。千万不能等细胞溶解了存状态把Trizol直接加到冻存管了,一起化开,振荡振荡就可以了。与从组织中提RNA 差不多。

八、做软骨组织的RNA提取,应当怎样开始试验?


1、 按RNA提取的要求处理研钵。


2、 研钵中加入液氮。


3、 将软骨组织放入盛有液氮的研钵内。


4、 研碎软骨,液氮蒸发完时加入适量的Trizol。


5、 待Trizol试剂恢复液态后吸入EP管中。


6、 然后按常规方法提取RNA。

九、黄曲霉rna提取(trizol法),加完异丙醇沉淀后得到的是接近透明的沉淀,加75%酒精洗涤后,加depc水能溶解,电泳后跑不出来带,有的点样孔很亮,是怎么回事?另外,是不是rna即使降解了也能跑出smear带?


2、 存在操作过程中残留过多的现象是点样口很亮,用氯仿抽提时,尽量不要吸到蛋白层,为保证RNA 的质量,水层可以稍稍多留点;照片说明RNA在 提取过程中降解了,出现了一片Smear。


3、 导致RNA 降解的原因很多,后的菌体用Pbs清洗后是不是用离心的方法收集的菌体。PBS洗涤后有没有把PBS完全吸尽;没吸尽的话可能导致trizol不能完全把菌体中的RNA酶抑制住从而导致RNA被完全降解。


4、 液氮研磨的时间并不重要,最好是快速而充分的研磨才是最必要的,而且中途不能让其解冻。觉得可以了就马上加trizol 一直研磨直至其变得像润肤霜就可以继续下面步骤了重要的是菌体量和 Trizol加的量有多大,如果Trizol加量相对少,就不能很好的裂解组织和细胞,同时也不能很好的保护RNA,RNA会被RNAase降解掉,所以可以适当增加Trizol的量。


5、 再有操作过程是否规范,最好都是用过滤嘴枪头,最好都是经过depc处理tip and tube 使用一次的橡胶手套,全程带口罩等等细节。至于电泳的问题只要是RNA专用的电泳槽, 电泳槽的问题不大,最主要是在提取的过程中RNA降解了。

十、提肝的RNA,效果很好,但提脑和卵巢却提不出来,都是同期采的样,不知道问题出在那里?


1、 使用组织提取RNA时组织必须新鲜,时间一长RNA便容易被内源性的RNA酶降解,即使把组织放在-80也阻止不了RNA酶的作用.如果用trizol提的话应该趁组织新鲜时先进行匀浆,再把匀浆液放于-80冻存.因为trizol本身含有酚,对RNA有一定的保护作用.


2、 DNA和RNA 的含量都是非常高的,脑卵巢中要少.注意RNase.最后溶解RNA加的DEPC处理水不要太多.在提取的过程中也要注意外源性RNA酶的降解,如果用trizol法的话,一般先降trizol加到研磨器中再加入组织研磨,整个过程中都要带手套,所有材料最好都要用DEPC水浸泡以后再高压。

(责任编辑:大汉昆仑王)

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