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EVA破晓自动挂机辅助手机版(EVA破晓刷副本) 安卓版
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装机必备软件新世纪福音战士首映十二年祭
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这是一部毁誉参半的科幻动画片，却在世纪末的“千禧情结”中取得了罕见的成功。自从问世以来，单是研究它的各种文献就已经达到了汗牛充栋的程度。人们关注它、解读它、争论它，不仅因为其中包含着诸多难以解释的谜团，更因为它对人类内心世界的深刻探讨。它就是《新世纪福音战士》。
　　　　 源起：“福音”诞生
　　　　对于国内的卡通爱好者来说，制作《新世纪福音战士》的日本GAINAX公司和这部动画片的总监督庵野秀明，显得既熟悉又陌生。说到“熟悉”，至今仍为国内卡通迷津津乐道的日本科幻动画片《蓝宝石之谜》就是由这家公司制作的。不过，与那些“历史”悠久的老牌动画制作企业相比，GAINAX公司也曾经只是日本卡通界的“新军”。而到了1995年，由于成功的推出了《新世纪福音战士》，GAINAX公司一跃而成为最具票房号召力的明星企业。
　　　　要说起这段传奇经历，我们就得先回到《蓝宝石之谜》在日本本土成功播出的日子。《蓝宝石之谜》在日本播出时的名称是《不思议的海之娜迪娅》，这部动画片改编自19世纪法国科幻小说大师儒勒?凡尔纳的名著《海底两万里》，于1990年在日本NHK电视网播出，并取得了相当高的收视率。
　　　　在那以后的五年里，GAINAX公司基本上没有制作新的动画片，而是把公司的主要资源集中在挖掘旧作的商业潜力和开发电子游戏软件的项目上。不过，GAINAX公司并没有打算放弃动画片的制作，而是在蓄积力量、发掘新题材。
　　　　一个很偶然的机会，公司动画制作部门的主将庵野秀明和贞本义行，在收看NHK的“脑与心”节目时，无意中得知了A10神经的存在。所谓A10神经，一般被认为产生于恋人或母子之间的精神纽带，有的心理学家也将它解释为心灵感性的源泉。这激发了他们的创作灵感，进而产生了“在机器人中有死去母亲的灵魂，通过与孩子的精神结合来启动，而且因为在孩子幼时母亲就死了，所以孩子很渴望母子间的爱”的想法。而正是由于这个大胆的构想，才催生出了堪称经典的动画名片《新世纪福音战士》。
　　　　为了能够使这部新作取得预期的效果，GAINAX公司成立了“Project Eva”部门，全面负责企划工作。总监督由庵野秀明担任，同时他还在本片中担任脚本制作和机械设定。两位副监督分别是摩砂雪和鹤卷和哉，同时他们还与通口真嗣一起负责分镜表。贞本义行负责全片的角色设定。作画监督分别是铃木俊二、本田雄和长谷川真也。此外，本片的美手术监督是加藤浩，摄影监督为黑田洋一，音响监督由田中英行担任。
　　　　TV版的《新世纪福音战士》于日至日期间，每周三晚上6点至7点在东京电视系播出，前后共播放26集。动画片推出伊始，并没有引起太大的反响，年平均收视率为7.1%，位居第37位。然而，随着录像带版和LD版的上市发行，这部动画片的影响力陡然上升，成为公众舆论聚集的焦点。甚至日本著名的《朝日资讯》上也刊出了这样的报道：“今天大家最关心的话题是什么？？答案是——人类补完计划！！”而这里提到的“人类补完计划”就源于《新世纪福音战士》。另据角川书店的《新人类》 杂志调查，随着动画片的“热播”，《新世纪福音战士》中的主要角色迅速取代了多年来广受欢迎的动画明星，成为卡通迷们的新宠。
　　　　录像带版《新世纪福音战士》，在内容上与TV版基本相同。而其中最有价值的是一集名为“in the Beginning”的总集编，收录了贞本义行与庵野秀明等制作人员的创作思想，至今依然是研究这部动画片的重要资料。在1996年中，Video版共售出了90万盒，在销售排行榜上名列榜首，而它也是当年进入排行榜前十位的唯一一部日本动画片。
　　　　在Video版发行的同时，LD版也悄然登场。最初发行的LD版包括“最早收录5枚”、 “复制版” 和 “特别通信版”等几种。其受欢迎的程度远远超过了Video版，仅前9集在1996年里就售出了110万件。而LD版最后一辑更是收录了1997年推出的两部剧场版。
　　　　相比较而言，DVD版的面世就显得有些迟缓。日，随着第二部剧场版的上映，收录了内容相当于《新世纪福音战士》第一至第四集的DVD版第一辑正式上市发行。迄今为止，包含了全部剧情的七辑DVD版已经全部出齐。与TV版相比，由于DVD作为大容量介质的特殊属性，制作者在保留原剧情基本不变的前提下，增加了部分在TV版中没有的新片段。就整体而言，DVD版可以认为是“高画质的LD版”。
　　　　从内容上看，《新世纪福音战士》以一次虚构的“灭世灾难”为背景，以享有“天使”称号的神秘生物与人类按照“天使”的形态制造的巨型机器人之间的战斗作为主线，塑造了不同于以往的“问题少年”形象。而且，整部动画片充分运用了包括意识流在内的前卫叙事手法，融会了心理学、宗教神学、哲学和未来学等现代科学理论，给人以耳目一新的感觉。
　　　　 名词解释
　　　　有人说：《新世纪福音战士》是一部需要拿着“说明书”才能够看懂的动画片。这多少有些调侃的味道。但是，从另一个角度上说，这部动画片的知识含量的确是很大，以至于许多初次观看它的观众，都有一种如坠云里雾中的感觉。为了能够帮助大家了解这部卡通巨片的方方面面，我们将与本片有关的各种名词分成六个部分，逐一介绍给大家。
　　　　 基础篇
　　　　死海文书
　　　　1947年，一个牧羊童在死海西北岸昆兰地区的一处位于泥炭岩断崖上的洞窟中，找到了一些大瓮。这些瓮中收藏着一些古代的羊皮纸卷。
　　　　这一发现，引起了一些西方探险者和考古学家的注意。为了能够获得更多的资料，考古学家们进行了，前后历时数年的大规模的挖掘和搜索。最终，一共获得六百余卷古代《圣经?旧约》抄本以及成千上万的文物残片。经放射性同位素碳14测定，确认其年代在公元前167至233年之间，大致相当于托勒密王朝统治后期至犹太教神权政体哈斯蒙尼王朝前期，是世界上现存最古老的《圣经》抄本。目前，绝大部分原件由以色列国家博物馆收藏。而因年代久远，大部分文书都已成了碎片，大小与平常使用的邮票相当。半个世纪以来，对“死海文书”的整理和研究工作始终在有条不紊的进行着。2001年底，《死海文书》的希伯来文版和英文版，由英国牛津大学出版社正式出版发行。
　　　　《死海文书》可以说是一个庞大的系统，共用希伯来文、亚兰文、希腊文、拉丁文四种文字写成，内容可分为两大部分。第一部份是希伯来的《圣经》、《次经》、《伪经》的抄本。第二部份被怀疑是具有神秘主义倾向的犹太教艾塞奈派，在昆兰隐居的社团成员遗留下来的各种文献，包括有《训导手册》、《圣经注释卷》、《战争卷》、《感恩卷》、《圣殿卷》五部份。其内容与现存的《圣经》不尽相同，除了现今可以对照确定的部份外，其余部分的来源和作者都已经无从考证。
　　　　在《新世纪福音战士》中，主要是借用“死海文书”的名义，并将其中涉及使徒的出现与人类起源，以及在“约束之日”时，第三次冲击会降临，所有的人类完全灭亡等内容加以变通和演绎，从而构成了故事的主干。
　　　　使徒
　　　　所谓“使徒”，也就是我们熟知的“天使”，或者直接音译为“安琪儿”。根据《圣经》和其他基督教文献，“天使”既是散播上帝福音的使者，又是“神的军团”。天使共分为三位九阶：上位三阶，包括炽天使、智天使和座天使；中位三阶，包括主天使、力天使和能天使；下位三阶，包括权天使、大天使和天使。
　　　　在《新世纪福音战士》中，“使徒”是人类对那些类似人类而又优于人类且来历不明的神秘生命体的统称。据说，这种生物的物质构成以及遗传基因图有99.89%与人类相同。它们分散在世界各地，经过了14年“孵化”，并依靠不同的能源演化出各异的属性。使徒一旦觉醒，就会马上向第三新东京市和NERV总部发起进攻，目的是为了夺回封印在“最终教条”里的亚当和莉莉斯。
　　　　作为人类的敌人，所有的使徒都持有超科学的特殊能力。它们的周身笼罩着波形信号呈蓝色的“绝对领域”，这也是判别使徒身份的重要特征。除了强大的“绝对领域”，它们还具备自我修复能力，有的使徒甚至还拥有分身或自我增殖的能力。所以，即使是人类掌握的现代化兵器也无法打败使徒，最多也只能延缓它的进攻。
　　　　使徒弱点是它们的动力源——名为“S2机关”的红色球型核心。如果，S2机关被破坏，使徒的行动便告中止。S2机关有时在使徒体外，有时隐匿于体内，也有分离的记录。在动画片中登场使徒前后共有十七个，各自以《死海文书》中天使名字命名。
　　　　卡巴拉生命树
　　　　“卡巴拉”一词源于阿拉姆迦勒底语，意思是“口述传统”。这个概念是由中世纪时期，遵奉神秘主义的犹太教“拉比” 。他们将古代的知识，以数字和字母的方式加以结合，作为解答宗教或哲学问题的依据。
　　　　“卡巴拉生命树”是一个由十个圆和二十二条线组成的树状图案。一般认为，生命树中的十个球面代表神的十面。树的左边代表男性，右边代表女性，中间则是两者和谐地带。对其信徒而言，那十个球面代表了人类所能够取得的能量。古代的宗教家认为“神”以一种似是而非的形态存在，人们或许能够理解神的某一部分属性，但却未必能认识到全部。因而，他们便给“神”设计了十个层次的属性，称之为“卡巴拉”；而连结这十种属性的路径结构，就是“卡巴拉生命树”。
　　　　国内较为常见的《EVA》研究文献对“卡巴拉”的解释大致如此。这个解释很可能是直接源自日本的研究文献，而且受制于知识结构和语言逻辑方面的问题，表述的并不清楚。根据犹太学研究相关人士的著述，“口述传统”按照希伯来语音译应为“马所拉”。它早在“巴比伦之囚”时期，就已经开始形成。最初是为了防止《圣经》被随意篡改，而将《圣经》句数和段落数、乃至每段、每句的字母数都严格精确计算。后来，出现了所谓“马所拉学士”，他们译注和坚定的《圣经》被认为是最接近原始风貌的权威版本。至于，上文中提到的那位犹太“拉比”是不是“马所拉学士”，则无从可考。
　　　　在《新世纪福音战士》中，“卡巴拉生命树”是TV版片头动画的重要组成部分，并作为人类补完计划的基础，在剧场版故事中出现。
　　　　通用人型作战兵器
　　　　常缩写为“EVA”。一般认为，Evangelion来自英文中的“Evangelist”，即马太、约翰等四位福音书的作者。在片中，EVA的另一个含义是“夏娃”，暗喻作为战斗机器人的EVA是按照第一使徒亚当的形态制造的。
　　　　根据“人类补完计划”，人工进化研究所和后来成立的NERV在极其秘密的情况下，研制了“Evangelion”。因为拥有与使徒相同的“绝对领域”，所以EVA是唯一能够与使徒匹敌的人造兵器。
　　　　通常情况下，EVA的生物性“素体”之上会覆盖有装甲板，但是其主要作用并非是为EVA提供保护，而是防止EVA意外觉醒。EVA在作战时，需要佩带外部电源供应管，其顶端形状类似于常见的三相插座。另外，其内部装备有可维持EVA五分钟运动的内藏电源，以便EVA在失去外部电源补给的情况下，能够继续作战。
　　　　EVA驾驶员称为“适格者”，这里指适合驾驶EVA的少年。根据选拔条例，适格者都是由马都克机关负责筛选和审查，然后再送到NERV。每一个适格者对应一架EVA，称为专属驾驶员。原则上，驾驶员不能互换座机。
　　　　事实上，EVA的各个部件都有其独特的象征意义。比如，为EVA供电的电缆象征着连接孕妇和胎儿的脐带；驾驶舱象征着母亲的子宫，而灌在驾驶舱内负责直接供给驾驶员氧气的LCL则象征着羊水。至于EVA的“绝对领域”，它象征着母亲对于子女的保护。
　　　　人类补完计划
　　　　关于“人类补完计划”及其内容，一直是“EVA”研究者们争论的焦点，因为这个“计划”是整个故事的基础环节。然而，在动画片中却始终没有给出明确的答案。
　　　　目前比较通行的观点是：人类都是由脆弱的物质构成的，所以也就非常容易受到伤害，而在人与人之间，心灵的世界是彼此隔绝的，要使人类向更高的领域进化，就必须使人的心灵摆脱躯体的束缚，重新回到人类的诞生之地“莉莉斯之卵”中。唯有如此，才能最终拆除人与人之间的心灵屏障，使不同的心灵世界能够相互补充，走向进化的终点——成为永生的“神”。人类补完计划就是为了实现这个神圣目的而创立的。
　　　　另一种观点认为：《圣经》中记述了伊甸园里有着被称为“智慧之树”和“生命之树”的树木。因为受到化身为蛇的邪神诱惑，亚当和夏娃偷吃了被视为禁忌的“智慧之果”，从而拥有了神才有的智慧和“羞耻之心”。神害怕他们在偷吃“生命之果”而获得永生。因此将亚当和夏娃赶出了伊甸园。并命令智天使，手持悬垂之剑，把守伊甸园的大门。“人类补完计划”的最终目的是打败把手大门的天使，取得“生命之果”，使人类得到永恒的生命，所以又有“迈向神之道”计划的别称。
　　　　第一种观点可能比较接近于“人类补完计划”的原始含义。而且在动画片中也有很多旁证和引证，也足以支持第一种观点。至于第二种观点的来源和立论依据尚不得而知，很可能只是根据《圣经》故事的臆想，与动画片内容似乎没有直接的联系，大概不足为信。
　　　　里死海文书
　　　　《里死海文书》在动画片中被定义为“死海文书”从未公开过的核心部分。同时，也是SEELE执行“人类补完计划”的具体规程，据称其中详细记录了计划的全部过程。
　　　　第二次冲击
　　　　公元日，一场自“文明时代”创立以来，前所未有的大灾变席卷全球。南极洲的冰盖在瞬间融化，海平面陡然上升，沿海都市化为泽国。伴随而来的还有地轴扭曲和地磁场的扰动，其结果是，地球环境和气候变更，饥荒、瘟疫和战争将地上世界变为“人间炼狱”，全球人口下降到原来的一半。
　　　　两年以后，联合国宣布这次灾变的原因是由于在南极大陆的玛卡姆山，受到了来自外层空间的大质量陨石，以光速数倍的速度冲击，导致连锁反应而造成的。并称，这是在地球40亿年的演化史上，继恐龙因陨星撞击地球而毁灭后，危害程度最深重的一起天灾，故称之为“第二次冲击”。
　　　　但事实却并非如此，根本就没有什么陨星从天而降。事实是，人类在不经意间找到了第一使徒亚当，但是作为神的亚当是不应该留在人间的。当莉莉斯来到人间试图找回亚当的时候，便引发了第二次冲击。最终人类设法用隆基诺斯之枪将莉莉斯封印在十字架上，并将他伪装成亚当的样子，希望在“约定的时刻”建立永恒的“千年王国”。
　　　　第二新东京市
　　　　由于在第二次冲击中，东京湾畔的旧东京地区被海水淹没。日本政府不得不在原来的长野县长野市营建新都，是日本政府的所在地。值得一提的是，原来的日本第一名牌大学、国立东京大学也在第二新东京市重建，并命名为“第二新东京大学”。包括葛城美里、赤木律子和加持良智在内的绝大多数NERV工作人员都毕业于这所大学。
　　　　第三新东京市
　　　　名义上是日本政府根据《第三新东京市迁都计划》营建的另一座新都，其位置大约在神奈川和静冈两县交界的箱根山上。新小田原港也在管辖之内，非常靠近海岸线。平时看上去依山傍海，绿树掩映，风景秀美，特别是在山上远眺落日余晖，堪称“美景如画”。
　　　　不过，表面上的秀美无法掩盖她凝重的杀气。其实，所谓“迁都”不过是个借口而已。建造这座新城其实是要开辟一块与使徒决战的战场。所以，第三新东京市在规划的时候，就已经被设计成一个拥有人类最杰出科技的战斗要塞。城市中，各种固定式、半固定式防御武器构成了密集的纵深防御体系，主要建筑物拥有装甲外壳，并可以降至地下，避难所和防空洞等设施一应俱全。
　　　　第三新东京市的地下部分称为“地下都市”，是NERV 总部所在地。虽然建在地下，但是却依然具有都市的一切必要特征。如果说，地面上的都市是要塞的外围，那么地下的都市则是要塞的核心。
　　　　有一种观点认为，地面上的第三新东京市和地下都市分别代表着人类心灵世界的内外两面。而使徒之所以要锲而不舍攻入地下都市，就是要了解人类的内心。
　　　　 机构篇
　　　　SEELE
　　　　“Seele”在德语中的意思是“灵魂”，也可解释为“心灵”。作为一个颇有神秘色彩的组织，SEELE早在“第二次冲击”到来之前就已经存在了，可以说整个“EVA的世界”都在它的掌握之中。
　　　　在片中，SEELE的成员一般并不直接露面。观众通常见到的，都是类似巨石阵列，并标有阿拉伯数字以及“Sound Only”字样的显示牌。据称这个组织常设成员有11人，都是各国的政要或实力人物，再加上NERV的总司令碇元渡，总共12人。似乎是为了仿照耶稣基督的十二门徒而刻意设计的。SEELE是一个拥有最高决策权的机构，有随时对任何人进行传唤和质询的权力。
　　　　在SEELE之下，有一个名为“人类补完委员会”的组织。这个组织据说是实现“人类补完计划”而专门设立的机构，其中的有五人是SEELE的常设成员，另一个成员则是碇元渡。有时候，冬月副司令也会以“列席”的身份，出席这个委员会的会议。
　　　　无论是SEELE还是“人类补完委员会”，核心人物都是“议长”基路?洛仑兹。不过，也有的研究者认为，其实SEELE和“人类补完委员会”，只是一个机构的两种形式。除了“议长”和碇元渡以外，其他的成员都是虚构的，而真正的幕后老板就是“议长”本人。
　　　　人工进化研究所
　　　　“Gehirn”在德语中的意思是“脑”。这是一个在“第二次冲击”前后建立的秘密科研机构。有可能是直接受SEELE或“人类补完委员会”的资助和控制。
　　　　它的主要职责主要有三项：研究“使徒”；开发和建造能够抵御使徒的“EVA系列”战斗机器人；研制具有人性化操作界面的超级计算机系统“三贤人”。
　　　　当身为教授的冬月增幸开始接触这个秘密科研机构的时候，碇元渡已经是研究所的所长了。而且，碇唯和赤木尚子也都在这里工作。至于后来NERV的战手术骨干葛城美里和技手术骨干赤木律子，最早都是这个部门的成员。
　　　　当MAGI系统在2010年研制成功以后，人工进化研究所也改组为NERV组织，从此在“EVA”的字典中消失。
　　　　特务机关NERV
　　　　“NERV”在德语中的意思是“神志”。这个组织由原来的“人工进化研究所”改组而成。与原来单纯的研究机构不同，NERV名义上是由联合国直辖的非公开组织，实质上却是受到SEELE和“人类补完委员会”控制的，具有超司法管辖权利的特种武装力量。
　　　　从表面上看，这个机构的任务是为了预防“第三次冲击”以及对使徒进行调查、研究、歼灭的工作，但真正的目的是为了执行“人类补完计划”。这个机构的核心负责人依然是“议长”基路?罗兰兹，最高司令官是碇元渡，副司令为冬月增幸。
　　　　NERV总部位于第三新东京市的地下城中，基地内的结构极为复杂，上下共分14层，由几千条自动通道相互连接。基地的中枢部位是中央指挥大厅。在大厅的中央，有一座三维电子沙盘，可以及时侦测战场的战况和推演战手术方案。
　　　　在组织机构上，总部下辖管理部，总务部，保安谍报部，特务部，特殊警备部，警备部，各部以下一般又有“局”、“课”两级编制。另有直辖机关两个，分别是第一研究所和第二研究所。除此之外，位于静冈县第三新东京市的富士试验场和长野县松代市的松代试验场都是NERV的附属机关。
　　　　除了位于日本的NERV总部以外，NERV还已知有三个海外支部。他们分别是NERV德国支部，负责EVA二号机的研制和生产；NERV美国支部，可能位于内华达州，负责EVA四号机的研制和生产；NERV美国支部，负责EVA三号机的研制和生产，但后因意外事故被完全摧毁。此外，依照NERV总部拟定的第二阶段整备计划，准备在三年内，在中国与澳洲建设新的设施。以此推断，剧场版中出现的九架量产型号“EVA”很可能是在德国、中国和澳大利亚生产的。
　　　　NERV徽章的图案部分是由半片枫叶和“NERV”的英文字母组成的，围绕在图案下面的文字是“God is in his heaven, all right with the world.”这是英国诗人罗伯特?布朗宁的诗作《Pippa Passes》中的诗句，译成中文是“神在他的天堂，世界万事妥当。”也有的研究者将这句诗翻译为“神不为者，人为之。”
　　　　马杜克机关
　　　　马杜克是古代美索不达米亚神话中开天辟地的创始神、太阳神和城邦保护神。传说，是他杀死了象征浑沌的怪物之母提亚马特，并用自己死后的遗体创造了世界。他是人类共同的祖先。在苏美尔城邦时期，能够赢得马都克神庙祭祀权的城邦就是整个苏美尔世界的霸主。
　　　　在动画片中，马杜克机关名义上是为了选拔EVA驾驶员而设立的一个咨询机构，直属于人类补完委员会。从记录上看，除了SEELE直接送来的第五适格者渚薰之外，其余的适格者都是由此机关加以甄选、审核之后，才送到NERV的。
　　　　不过，根据暗中潜入NERV内部做调查的加持所得到的情报显示，跟这个机构有关系的108家公司中，有107家都是子虚乌有的挂名公司。在遮遮掩掩的障眼法背后，掩藏着EVA驾驶员产生过程的核心机密。
　　　　盟军
　　　　联合国掌握的常规武装力量，片中称为“战略自卫队”或简称“战自”。但是根据惯例，联合国军在承担战斗任务时，应该称为“多国部队”或“盟军”。
　　　　他们曾经是最早抗击使徒的力量，但因为常规战法对使徒无效，因此不得不把作战任务转交给NERV。在剧场版中，因为SEELE声称，NERV将引发“第三次冲击”。盟军便派出精锐的特种部队，对NERV总部展开“斩尽杀绝”的全面摧毁行动。由此可见，SEELE对于盟军和联合国都有极大的影响力。
　　　　NERV的绝大多数成员都在这次“屠杀”行动中丧生。然而，随着EVA二号机的觉醒，盟军的行动完全失败，最终全军覆没。
　　　　 使徒篇
　　　　第一使徒 亚当
　　　　享有“人类始祖”的美誉，但却也是造成“第二次冲击”的原因。后来，被还原成最初的胚胎形态，并凝固在树脂中。在片中，它是“人类补完计划”得以实现的重要环节。由加持良智从NERV德国支部秘密押送到NERV总部，并植入碇元渡的右手手腕中。
　　　　第二使徒 莉莉斯
　　　　根据犹太教的经典记述，莉莉斯是亚当的第一个妻子，后来因为不甘心屈服于亚当而逃离伊甸园。
　　　　在动画片中，NERV总部的核心禁区“最终教条”里，有一副巨大的十字架上，上面封印着一个白色的、拥有七只眼的巨人，见过它的人都以为他是第一使徒亚当。但是，当化身为“渚薰”的第十七使徒来到这里的时候，却发现暗藏在“亚当”面具下的是第二使徒莉莉斯的真身。原先她只有上半身，但隆基诺斯之枪被拔去后，便开始长出足，而且腹部开始膨胀，有妊娠迹象。她的灵魂则被注入到绫波丽的体内。
　　　　亚当和莉莉斯的儿子是第十八使徒路西法，也翻译为“李林”。他曾经贵为“天使长”，后来因为背叛神的意志而“堕落”。在片中，渚薰曾多次用“李林”代指人类，这其中有两层含义：第一，指人类是亚当之子；第二，指人类是“判神者”，背负“原罪”。
　　　　第三使徒 水
　　　　又写作“Sakkiel”，在《圣经》中是守卫七层天界中第六层的天使。在片中，它是率先向第三新东京市发起进攻的首个使徒。经“三贤人”系统的调查证明，它并非是遥控的机器人，而是具有自主行动能力的智慧生命体。后被处于“暴走”状态的初号机消灭。
　　　　第四使徒 昼
　　　　在《圣经》中，它就是守护伊甸园的天使。在片中，它从太平洋上飞来，有着蠕虫一般的身形。它有两条形如“长鞭”的触手，能切割并溶解任何阻挡物。最终，被初号机用高振动粒子刀刺中S2机关，随即停止行动。
　　　　第五使徒 雷
　　　　又写作“Remiel”，在《圣经》中是七位大天使之一，支配真实的幻影。在片中，它是以正八面体的形态出现的，可以说是攻守兼备的空中要塞。它以镜面化的“绝对领域”来防御一切物理攻击，并用加速粒子流进行反击。最终，在由葛城美里策划的“屋岛作战计划”中被消灭。
　　　　第六使徒 鱼
　　　　造型极为类似侏罗纪时代的水中爬行巨兽“平滑侧齿龙”。藏匿在浅海中，在毫无征兆的情况下，突然向负责运送EVA二号机前往NERV总部的盟军太平洋舰队发动攻击。曾经一度将二号机吞入口中。最终，被二号机掰开嘴巴，并用大型战舰的主炮以零距离攻击摧毁。
　　　　第七使徒 音乐
　　　　又写作“Israfile”，在《圣经》中是负责吹响“末日审判”号角的天使。在片中，它是拥有“阴阳鱼”般的双核心而唯一具备分身能力的使徒，无论远战或者近战都有出众表现。初次交锋中，曾经同时击破初号机和二号机的联手进攻。最后，在“62秒作战”中，被两架EVA以高度协调的同步攻击挫败。
　　　　第八使徒 胎儿
　　　　在《圣经》中，它是第五层天界的守护天使。在片中，它是唯一在孵化前被NERV找到的使徒。然而，在捕捉的过程中，第八使徒突然觉醒，并急速孵化成形。它能够在高温高压的熔岩里高速移动，具有超常规环境适应能力。最后，在初号机的支援下，被二号机消灭。
　　　　第九使徒 雨
　　　　形如巨大的蜘蛛。在NERV总部电力供应系统遭到人为破坏期间，向第三新东京市发动进攻。它的主要武器是类似强酸的腐蚀性液体，其作战目的似乎并不是攻入NERV总部，而是摧毁EVA系列。后被三架EVA联手消灭。
　　　　第十使徒 空
　　　　从印度洋上空突然袭来的飞鸟状使徒，其体积异常庞大，身体能够分泌出雨滴状的“航弹”，而且它本身就是一枚威力巨大的炸弹。在瞄准第三新东京市后，便开始加速下坠，企图以自杀方式与NERV总部同归于尽。最终被三架EVA合力以最强“绝对领域”阻止，随即被摧毁。
　　　　第十一使徒 恐怖
　　　　形态接近于细菌且用肉眼无法辨认的微生物，具有强大的适应和进化能力。它是在EVA模拟体实验中，从第八十七层蛋白壁开始侵入总部，并不断分裂增殖，最终侵入“三贤人”电脑系统，试图引发NERV总部的自爆。最终，在“进化的末端”与“三贤人”系统达成共生关系，第十一使徒随即消失。
　　　　第十二使徒 夜
　　　　外表是浮动在半空中的圆形球状体，外表遍布黑白色条纹，但事实上那只是使徒的影子。其本体是地面上看似阴影，直径为六百米，厚度为三十亿分之一米的黑色区域，其内部是连接不同维度宇宙的边缘区域，也称为“虚度空间”。真嗣驾驶的EVA初号机，在不明真相的前提下，被黑影吞噬十数小时。在内部能源耗尽的情况下，初号机突然觉醒，从内部撕裂使徒。
　　　　第十三使徒 霞
　　　　与云层和雷电有关的神秘使徒，很可能是在EVA三号机从美国支部运往日本的途中侵入并潜伏在三号机内部的。在松代试验场进行启动试验时觉醒。最后，被由“Dummy System”操作的初号机粉碎。
　　　　第十四使徒 力
　　　　号称“史上最强悍”的使徒，手臂是锋利并且伸缩自如的带状物。在真嗣不在NERV的时候，突然袭来，并突破表面装甲侵入地下城中。在相继击败零号机与二号机之后，直逼NERV总部中央作战大厅。危急时刻，真嗣驾驶EVA初号机出战，并以创纪录的400%的同频值摧毁使徒。
　　　　第十五使徒 鸟
　　　　形如巨鸟，被明亮的闪光所覆盖的使徒，最初出现在地球同步轨道上，并具备非物理性的精神攻击武器。最后，由零号机用隆基诺斯枪射穿其“绝对领域”后被歼灭。
　　　　第十六使徒 子宫
　　　　给人以诡异感觉的使徒。从外表上看，它似乎是一个双螺旋状的光带，首尾相接构成的圆环，直径在一千米左右，外形可随意变化。曾一度侵入零号机体内，并且欲与凌波丽融合。最终，在零号机的自爆中被消灭。
　　　　第十七使徒 自由
　　　　它以人的外形出现，化名渚薰，由人类补完计划委员会以第五适格者的名义送到NERV。它也是唯一侵入“最终教条”的使徒。而且，也是揭示出十字架上巨人真面目的人。最后，以获得“绝对自由”的名义，请求真嗣将自己处死。
　　　　 技手术篇
　　　　绝对领域
　　　　“A?T?FIELD”是“Absolute Terror Field”的缩写，直译为“绝对恐怖的领域”或“绝对不可侵犯的领域”，一般称为“绝对领域”或者“绝对震慑场”。
　　　　确切地说，“A?T?FIELD”就是EVA和使徒共有，由强大能量构成的防护屏障，只要这个屏障足够强大，便可以抵挡所有的常规物理攻击。另外，因为形成的原因是空间相对位移，所以除了防御之外，“A?T?FIELD”也可作为攻击性武器使用。而打败使徒的关键，就是用EVA的绝对领域中和使徒的绝对领域，之后设法击碎使徒的红色核心。
　　　　根据第十七使徒渚薰的解释，所谓“绝对领域”，就是“任何人也无法侵犯的神圣领域”、“心之光”、“在谁心里都存在的心之壁”。其隐含的心理学意义是“心灵的最终防线”。而“人类补完计划”的最终目的，就是打破所有人心中的“绝对领域”。
　　　　LCL
　　　　LCL是“Link Connected Liuid”的缩写。这是一种注入EVA驾驶舱内的黄色、有血腥味的粘稠液体，其成分与原始海洋极其类似。驾驶员搭乘后，由电核重组分子，将驾驶员的神经与EVA连接，向驾驶员肺部直接提供氧气。同时，还可以在战斗时减缓物理冲击，隔绝精神污染，担负生命维持的任务。据称，LCL象征着母亲体内的“羊水”，是子女的生命原动力。
　　　　S2机关
　　　　S2是“Super Solenoid”的缩写，字面意思是“超级螺线管”。
　　　　在动画片中，S2机关是指使徒的中枢部位，外形通常为红色球体。在理论上，是可以永久运作的半永动机。这意味着，使徒几乎拥有无限的行动能力。这与EVA只能够依靠内置电池运行五分钟的情况相比，的确是一个非常明显的优势。几乎所有使徒的体内，都内置S2机关。而如果S2机关遭到破坏，使徒也就丧失了战斗和行动的能力，并时常会引起大规模的爆炸。
　　　　在剧场版中，量产型的EVA也装备了S2机关。由此可知，EVA和使徒并没有什么本质的区别。
　　　　同频值
　　　　这个数据用来反映驾驶员与EVA之间的协调性。由于EVA是神经联结方式进行操作的，因此这个数据对于战斗的胜负至关重要。
　　　　在普通状态下，这个数值是在0%至100%的区间内浮动。一般而言，数值越高，协调性越好，相应的，战斗与防御能力随之上升。而且，高同频率是EVA潜在能力的必要条件。真嗣就曾经以创纪录的400%的高同频率，引发EVA初号机的觉醒，并击败了号称“最强使徒”的第十四使徒。相反的，同频率呈逆流下降状况时，EVA的性能也随之下降。当数值降至0点时，EVA便停止活动。明日香就曾经因为同频率呈现负值而无法再操纵EVA二号机。
　　　　“三贤人”系统
　　　　由赤木尚子博士开发的，搭载有人格移植操作系统的超级生物型计算机系统。它由三台独立的计算机系统组成，并以东方三圣者 命名，即MELCHIOR?Ⅰ、BALTHASAR?Ⅱ、CASPER?Ⅲ。它们分别代表着赤木博士作为科学家，作为母亲与作为女性的三种思维模式。一般而言，当向MAGI提出的问题之后，由三台计算机共同评议其可行性，并以简单多数表决。但是，诸如决定是否引起“自爆”之类的重大事项，必须由三个系统的全部运算单位一致表决通过。
　　　　同时，MAGI的备份系统还被美国、中国与德国等许多国家作为处理国政的国策顾问。据称，它能够保证在社会基本稳定的前提下，将国家建设和公共预算支出降至最小，以便能够保证NERV的战费支出。当然，作为NERV的主计算机系统，MAGI主要还是用于NERV的管理、科研，以及对使徒的作战分析。
　　　　暴走
　　　　在日语中有“疯狂”、“失控”的意思。在初号机驾驶员失去意识或者生命受到威胁的时候，初号机能在失去能源供应的情况下再启动。这种情况被称为“暴走”。而失控后的初号机，往往能够爆发出超乎寻常的强大能量。无论使徒的力量有多强，在“暴走”的初号机面前都不堪一击。而“暴走”的实质，就是当人类面临危险时所爆发出来的“生命能量”。
　　　　 EVA篇
　　　　EVANGELION零号机
　　　　简称“零号机”，它是EVA系列最早研制成功的试产品。在片中，因为绫波丽的受伤，曾经一度封存。直到“屋岛作战计划”实施时，才重新加入战斗序列。
　　　　早期的零号机机身以黄色为基本涂装。在外形上，它与其它EVA的主要区别在于：两肩没有板状的突出装甲。在TV版的后半部分，零号机以崭新的蓝色改装型登场。在外形上，除头部之外，已经与EVA二号机相当。零号机的专属驾驶员是第一适格者绫波丽。
　　　　据说，零号机的体内封存着赤木尚子的灵魂。这也就是为什么零号机失控后，会向碇元渡和绫波丽进攻的原因。
　　　　在与第十六使徒的战斗中，绫波丽启动了自爆装置，零号机与使徒同归于尽。
　　　　EVANGELION初号机
　　　　简称“初号机”，它是最早投入与使徒作战的EVA，属于EVA战斗测试模拟型。在一般情况下，EVA初号机是左右战局的关键。
　　　　在以紫色为基调的装甲板内，隐藏着与使徒类似的神秘生命体。其控制力和战斗力波动性很强，但每每在关键时刻，都能够爆发出超乎想象的强大力量，保证驾驶员全身而退。据说，这是因为初号机体内，封存着真嗣母亲碇唯的灵魂，因此真嗣才能够在完全没有训练的情况下，与EVA达成同频。初号机的专属驾驶员是第三适格者。
　　　　在剧场版中，初号机在空中展开“光之翼”构成了生命之树的骨干。然而，由于真嗣最终不愿敞开自己的内心，“人类补完计划”失败，初号机也变成了石像。
　　　　EVANGELION二号机
　　　　简称“二号机”，它是唯一建成，并受NERV总部支配，用于实战的战斗型EVA。
　　　　二号机在通常装备红色B型近距作战装甲。由于是战斗型机器人，它所能够使用的武器，也是EVA各型号中最多的。二号机是由NERV德国支部负责建造的，其专属驾驶员是第二适格者明日香。而在二号机体内，封存着明日香母亲的灵魂。
　　　　在TV版的后半部分，明日香因为自信心的粉碎和精神污染，完全丧失了驾驶EVA的能力。这才使得渚薰能够以第五适格者的身份进入NERV总部。在剧场版中，重新恢复自信的明日香驾驶EVA二号机孤身与九架量产型EVA苦斗，最终因电力耗尽，二号机被敌人肢解。
　　　　EVANGELION三号机
　　　　简称“三号机”，由NERV美国支部建造，后运往日本。基本性能与二号机相同，装备有黑色装甲。三号机的专属驾驶员是第四适格者铃原东治。由于使徒侵入，在首次启动试验中失控，最终被初号机歼灭，铃原也因此身受重伤。
　　　　EVANGELION四号机
　　　　简称“四号机”，性能同二号机，只是装甲改为白色。在搭载S2机关的实验中遭遇意外，与NERV美国支部一起毁灭。
　　　　EVANGELION五号机
　　　　EVA五号机是EVA系列的批量生产型号，据称建造了十三架，但是在剧场版中只有九架登场。它们并不属于NERV系统，而是直接授命于SEELE。
　　　　事实上，它们是装备最精良的EVA，搭载了S2机关、无人驾驶模拟操控系统、巨大的仿生翅膀和仿制的隆基诺斯之枪，其实力远远超过任何使徒。但是，打败NERV控制的EVA，只是量产型EVA的“热身运动”，它们的主要职责是执行“人类补完计划”。
　　　　 武备篇
　　　　高震动粒子刀
　　　　EVA与使徒之间的战斗往往是近身搏击的遭遇战。因此，高震动粒子刀是每架EVA都必备的标准格斗装备
　　　　高震动粒子刀的外形与我们常见的美工刀十分相似，不过刀刃的方向与美工刀相反。这种刀的刃是由高爆粒子颗粒组成的，可以将接触到的物质分子分解、切断。当刀上的粒子开始震动之后，刀刃的边缘就会发光，威力会加倍。在近战格斗中，可以给敌人致命的伤害。
　　　　相比较而言，二号机装备的粒子刀与初号机有所不同。它的刀刃有自我修复功能，能够在折断后迅速恢复。
　　　　阳电子步枪
　　　　EVA标准装备。与先前使用的普通自动步枪相比，它使用高速射出的阳电子作为子弹，具有不使用通用弹夹的优点。这就省却了战斗时换子弹匣的麻烦，提高了战斗效率。这种枪的枪托部分是呈8字形的加速器。
　　　　平斧
　　　　EVA主战装备。与高震动粒子刀同为近战兵器，工作原理类似，但是只是在第十六集中由二号机使用过。
　　　　音速矛
　　　　EVA主战装备。明日香驾驶的二号机在与第七使徒的战斗中使用过的长刀状武器。它的锋刃部分与高震动粒子刀相同，在与物质接触时，会将分子分离、切断。当两架EVA机一起使用时，两把音速矛之间还会形成一个平面力场，把敌人从中间斩断。
　　　　改造阳电子炮
　　　　由EVA初号机使用。为了在超长距离射击第五使徒，NERV技手术部门改装了盟军的阳电子自行火炮。并以全日本的电力作为启动能源。在第二次狙击中，将第五使徒摧毁。
　　　　耐热光波防御兵器
　　　　由EVA零号机使用。为了防御第五使徒的攻击，而使用SSTO的剩余物质紧急赶造的盾。由于表面经过超电磁强化，可以抵挡第五使徒的强粒子光束超过17秒。为改造阳电子泡赢得了重新装填的时间。
　　　　隆基诺斯之枪
　　　　又名“朗基劳斯枪”。据说是由在第一次冲击中灭绝的古代人类所研发的最终武备，是唯一能够封印神的兵器。而且，还是可以轻易戳穿“具象化的心之壁”最强兵器。原本用于封印第一使徒亚当。后来，由碇元渡等人从南极带回。由零号机将其刺在莉莉斯的胸口。在与第十五使徒的战斗中。被零号机用来攻击在卫星轨道上停留的第十五使徒，随后便留在月球轨道上，处于不可回收状态。直到剧场版中，人类补完计划开始时，才作为仪式的一部分重新回到地面。
　　　　隆基诺斯之枪的实质是A10神经的具象化。所谓的A10神经，是恋人、母子之间的心灵纽带，即使分隔人类的心灵屏障也无法将之隔绝。
　　　　此外，剧场版中登场的量产型EVA也装备有仿造的隆基诺斯枪，用于攻击二号机的绝对领域。
　　　　“隆基诺斯”源自《圣经?新约》中记述的那个用枪去刺被缚于十字架上的耶稣基督的士兵之名。
　　　　NN炸弹
　　　　又名“N2地雷”，意为非核武器，是实际威力与核武器威力的相当超级炸弹，也是唯一能够延迟使徒前进的常规武器。
　　　　 人物介绍
　　　　碇真嗣
　　　　《新世纪福音战士》的男主角。NERV司令碇元渡的独子。十四岁时，依照父亲的来信，赶到第三新东京市，亲眼目睹了使徒的来袭。在没有接受过任何专门训练的情况下，真嗣乘坐EVA初号机出战。后来，以第三适格者的身份成为EVA初号机的专属驾驶员。由于时常能够超极限发挥EVA初号机的战斗力，实际上是NERV对抗使徒的主力。
　　　　在性格上，他趋向于“中性”，本质善良，腼腆而内向，但有自闭倾向，不善于交流。幼年时，因为目睹了母亲碇唯在试验事故中被“消灭”，精神受到了极大的打击，从而留下了挥之不去的心理阴影。再加上父亲的漠不关心，导致亲情的疏离。对与他人的接触怀有恐惧，处事态度消极。总是机械的回答“是的”、“对不起” 之类的话，借此避免受责备。不过，因为长期独居，对家务相当内行。在他寄居在葛城家的日子里，几乎都是靠他来操持家务。
　　　　促使他驾驶EVA的最初动机，是希望能够以此得到父亲和他人的称赞。平时显得相当的阴郁，习惯于把过去的记忆封锁起来。而在他的潜意识中，还有截然不同的另一个人格。然而，随着剧情的发展，真嗣的人生态度和思维方式都发生了很大的变化，不但自信心逐渐确立，而且日益渴望与他人交流。但在剧场版中，真嗣又回到了原来的自我。最终，也正是因为他不愿意敞开自己的内心，才导致“人类补完计划”的失败。
　　　　事实上，在本片最初的策划案中，主角是遵循着“主人公为女孩，身边有个教练式的姐姐”的原则被设定为类似于“明日香性格”的少女。但是，由于此前GAINAX制作的动画片大多以女性为主角，而且“作为乘上机器人并进行训练的女性，虽然这样有说服力，但让人无法明白年轻女孩乘上机器人的理由。 ”同时，总监督庵野秀明也认为“机器人的作品就应是男性主人公。”最终决定，将本片的主角设定为有中性特征的男性少年。这才有了我们熟知的“碇真嗣”。
　　　　为“碇真嗣”配音的是绪方惠美。她曾经在《幽游白书》中为“藏马”配音，在《X》中为“牙晓”配音，在《魔法骑士RAYEA如题H》中为“Emerodo公主”配音。她的声音有典型的中性特点，同时加上对角色性格的正确把握，使她成功塑造出了真嗣的忧郁形象。
　　　　物流?明日香?兰格丽
　　　　留着棕色长发的天才少女，身上有四分之三的德国裔和四分之一的日本裔血统。随二号机从NERV的德国支部转来日本，并以第二适格者的身份担任EVA二号机的驾驶员。虽然，她平时也和真嗣、以及凌波丽一样在中学读书。但事实上，却是早已经在德国完成了大学学业。
　　　　表面上，她性格外向，个性极强，自尊心盛，不肯轻易认输，加上样貌出众，是学校里公认的“美女”。同时，她还是个着强烈自我意识的人，多少给人以早熟的感觉，经常以盛气凌人的架式教训真嗣。但是，内心却相当的孤独和脆弱，很少能够坦诚地面对别人。
　　　　她的母亲也曾经是为NERV工作的科学家。为了能够尽快找到使EVA和驾驶员达成同步的方法，不惜亲身进行危险的实验，结果却受到精神污染而导致精神错乱。此后，曾经试图让年幼的明日香和自己一同自杀。这段极不愉快的经历，成为了明日香内心深处挥之不屈的阴影。
　　　　她负责驾驶的是EVA二号机。虽然二号机是正式建造的第一款专用实战型EVA机器人，但在战斗中的表现却明显不如真嗣驾驶的初号机。喜欢争强好胜的明日香，时常为此感到愤怒，同时这也严重挫伤了她的自尊。在TV版中，她因在和第十五使徒的交锋中遭到精神污染而无法继续参加作战。在剧场版中，明日香才得以重新找回自我。
　　　　明日香的形象设定，在漫画版和动画版中稍有差别。漫画版中的明日香，个子比真嗣略高，更接近于对“明日香”这一角色的原始设定。至于动画版中的某些修正，主要是为照顾配音演员的音色。其实，明日香才是本片真正的女主角。但是，在实际播出过程中，“女二号”绫波丽的人气远远超过了明日香，因此也就不得不屈居第二。
　　　　负责给“明日香”配音的是宫村优子。她曾经在《精灵狩猎者》中为“井上律子”配音。为了能够成功地塑造“明日香”，宫村甚至特地抽时间去学习了德语，专业精神和工作态度可见一斑。由于她在本片中的出色表现，从而成为日本声优界的新星。
　　　　绫波丽
　　　　有着一双血红色的眼睛和灰色头发的冷艳少女，外貌酷似真嗣的母亲碇唯。在E计划启动阶段就开始接受特殊训练，并以第一适格者的身份担任EVA零号机的驾驶员。她的过去被精心的掩盖起来，以至于让人觉得似乎她根本就没有过去。
　　　　在最初的故事中，她沉默寡言，表情也相当的贫乏，性格上非常的冷漠。而且，无论交给她多苛刻的任务，都不会有任何异议。在她所住的房间里，除了必需家具之外，没有任何的装饰和电器。在众人的印象中，除了曾经冒险救过她的碇元渡之外，她从未对任何人微笑过。直到在与第四使徒的战斗中被真嗣救下以后，她的性情才发生了微妙的变化。
　　　　事实上，绫波丽的真实身份是利用碇唯的遗传基因制造出来的人造人，而她的体内封印着第二使徒莉莉斯的灵魂，是“人类补完计划”施行的关键之一。
　　　　其实，我们这里所说的“绫波丽”其实是三个人物。第一个绫波丽早已经被“三贤人”系统的开发者赤木尚子掐死；在片子前半段中出现的绫波丽是第二个绫波丽，也是逐渐趋于人性化的绫波丽，但她为了保护真嗣而启动了自爆装置，与第十六使徒同归于尽；在TV版尾声和电影版中出现的绫波丽是第三个绫波丽，虽然她有第二个绫波丽的记忆，但却失去了她的人格和感情。
　　　　给“绫波丽”配音的是林原惠美。她曾经在《DNA2》中为“佐佰伦子”配音，在《三只眼》中为“佩”配音，在《秋叶原电脑组》中为“大鸟居燕”配音，在《秀逗魔道士》中为“莉娜”配音，在《宇宙战舰山本洋子》中为“御堂圆”配音，在《影技》中为“美宁”配音，在《碧奇魂》中为“藤宫红叶”配音，在《乱马1/2》中为“乱马”配音，在《魔神英雄传》为“忍部日美子”配音。除此之外，在本片中，她还负责真嗣的母亲“碇唯”，以及葛城美里家的温泉企鹅“片片”的配音工作。一个人要负责三个角色的确有些辛苦，但应该承认她塑造的每一个角色都很成功。
　　　　渚薰
　　　　他是以第五适合者的身份被SEELE直接送进NERV的少年。身材瘦长，有着和真嗣类似的中性性格。令人疑惑的是，他拥有自由控制同频率的特异功能。在淡淡的微笑之下，似乎隐藏着深不可测的内心。
　　　　虽然出现了的时间不长，但却让真嗣产生了一种难以言喻的亲密感。因此，当真嗣得知他的真面貌是第十七使徒的时候，真嗣感到了前所未有的被出卖感。而且，渚薰与绫波丽接触也使得绫波丽体内的莉莉斯之魂觉醒。
　　　　他姓名中的“渚”拆开来就是“シ”与“者”，在日语中意为“死者”或者“使者”。
　　　　为“渚薰”配音的是石田彰。
　　　　铃原东治
　　　　铃原是第三新东京市公立第一中学的学生，真嗣的同班同学，说话带有明显的关西口音。他是那种典型的“运动男孩儿”，性格张扬，但做事时常考虑不周，也不太善于适当地表达自己的感觉。他的妹妹在初号机与第三使徒的作战中，意外受伤。东治曾经将妹妹的受伤归罪于真嗣的错误，并为此打了真嗣。后来，两人最终取得了谅解并成为好友。
　　　　谁也没有想到，铃原居然以第四适格者的身份，被挑选为EVA三号机驾驶员。然而，当三号机在松代试验场接受启动试验的时候，遭到了第十三使徒的入侵，导致全面失控。后被初号机在自动状态下完全摧毁。铃原虽然侥幸生还，但却身受重伤。
　　　　为“铃原东治”配音的是关智一。
　　　　葛城美里
　　　　她是亲身经历过“第二次冲击”的少数幸存者之一。在发生爆炸的当时，她的父亲拼命将她救出。由于那次灰色的经历，她曾经一度罹患“失语症”。
　　　　大学毕业后，怀着为父报仇的目的加入NERV，随后成为作战部长。同时也是三个驾驶员的直属上司，在NERV里是仅次于正、副司令的第三号人物。有着非常出色的战斗组织和策划能力。后因战功卓著而由一尉晋升为三佐。
　　　　因为真嗣和明日香寄住在她家里，所以她还要作他们的监护人。虽然，她表面上的性格外向、活泼开朗，常常以啤酒加方便面的乐观方式面对生活。可是，当年的心理阴影始终困扰着她，对此她只是曾经在酒醉后向加持良智吐露过。从某种意义上说，葛城和真嗣是同一类人。在剧场版中，葛城为了保护真嗣被流弹击成重伤。在将真嗣最后一次送上EVA之后，她也咽下了最后一口气。
　　　　为“葛城美里”配音的是三石琴乃。她曾经在《碧奇魂》中为“泽口小梅”配音，在《饿狼传说》中为“不知火舞”配音，在《美少女战士》中为“月野兔”配音。作为一名适应力极强的配音演员，她善于根据不同的脚本设定调整音质音色，塑造出不同性格类型的人物。
　　　　赤木律子
　　　　“三贤人”系统开发者赤木尚子的女儿，也是E计划的早期参与者之一。在第二新东京大学时，与加持良智和葛城美里相识，并成为好友。后成为NERV技手术开发部门首席科学家，是NERV的四号人物。
　　　　作为一名才智过人的科学家，她的个性属于绝对理智型，处事果断而明快，同时又有着敏锐的直觉。在绝大部分情况下，都身着标准的工作装，有时也给人以不近人情的感觉。在整个故事中，她似乎始终处于边缘地位，以一种超然的姿态审视一切。但是，作为第一流的技手术相关人士，她曾经以高超的计算机技手术两度挫败了入侵者试图借助主电脑炸毁NERV总部的图谋。据传说，她和碇元渡有暧昧关系。在剧场版中，她曾试图自行引爆NERV的主电脑，但却以失败而告终，最后死在碇元渡的枪口下。
　　　　为“赤木律子”配音的是土井美加。她曾经在《超时空要塞MACROSS?可曾记得爱》中为女主角“早濑未莎”配音，是一位善于把握女性特征的配音演员。
　　　　加持良智
　　　　他是个酷爱冒险，好奇心强，善于处理各类棘手事件的家伙。同时也是葛城美里在学生时代的恋人，而且还一度同居，但后来两人分手。按葛城的说法，在加持的身上能够看到葛城父亲的影子。
　　　　当他在本片中出场的时候，已经是NERV特殊监察部的高级干部。表面上的任务是从NERV德国支部护送明日香和EVA二号机前往日本，实际上却是负责秘密押运已经封印在卵中的第一使徒亚当前往NERV日本总部。
　　　　在生活上，他是个不修边幅的浪荡公子，但却很受女性的欢迎。据说，他最大的爱好是在地下都市的空地上栽培西瓜。每每在关键时刻，总能够给真嗣鼓励，帮助真嗣恢复自信心。而对于工作方面的事情，态度极其认真，就连一向待人冷漠的碇司令也对他非常的信任。然而，他的真实身份是日本政府内务省调查部的间谍。最后，由于身份败露而试图撤离。但最后似乎是被葛城美里亲手击毙。
　　　　负责给“加持良治”配音的是山寺宏一。他曾经在《八犬传》中为“犬山道节”配音，在《乱马1/2》中为“响良牙”，在《天空战记》中为“龙王良马”配音，在《魔神英雄传》为“库拉玛”配音。
　　　　碇元渡
　　　　主角碇真嗣的父亲，NERV机关的最高司令长官，是本片中众多谜团的焦点。他原姓六分仪，和碇唯结婚后改姓碇。至于他更改姓氏的原因，片子中始终未作交待。按照日本人的习惯，夫妻结婚以后，妻子应该改随夫姓。而如果是丈夫改随妻姓也就意味着入赘妻家，而入赘对男方要来说是极大的牺牲。
　　　　他从学生时代开始就是一个相当神秘的人。据说是为了能够更多的了解碇唯身后的秘密组织，才与碇唯交往的。在“第二次冲击”发生之后，他就全力投入与此有关的各种研究。事实上，他和《人类补完计划》以及NERV的成立都有着很深的瓜葛。曾经担任NERV的前身——人工进化研究所的所长。在妻子碇唯意外丧生之后，他更加积极地推动“人类补完计划”的实施。2010年，人工进化研究所改组成为SEELE直属机关NERV，碇元渡随即成为NERV的最高司令长官，并以总负责人的身份参与整个EVA 开发计划。此外，他还是SEELE的成员和执行官，负责“人类补完计划”的实施。然而，他真正的目的，是希望通过“补完计划”，与妻子碇唯重会。为了达到这个目的，他不惜付出一切。从这个角度上说，虽然他表面上无视人性与感情、处事极为冷酷，但是骨子里却是个痴情种子。
　　　　根据贞本义行先生的说法，碇元渡是以《谜の圆盘UFO》中的斯特雷塔司令官的形象为原型设计的。
　　　　为“碇元渡”配音的是立木文彦。
　　　　冬月幸增
　　　　他原本是京都大学的生物学教授，同时也是碇唯的老师。在“第二次冲击”发生之后，曾经与元渡一起前往南极调查事件的真相。后来，在碇元渡的鼓动下，加入人工进化研究所。后来，和碇元渡一起转入NERV，成为NERV的副司令长官，是基地的二号人物。在碇司令不在的情况下，有代行司令的权力。在所有角色中，他的年龄较大，但洞察力极为敏锐，严峻冷峻，有着非常强的正义感。对于整个计划有着超越常人的了解，但却始终保持沉默。
　　　　根据贞本义行先生的说法，冬月增幸是以《谜の圆盘UFO》中的副司令官瓦利曼的形象为原型设计的。
　　　　负责给“冬月增幸”配音的是清川元梦。
　　　　碇唯
　　　　真嗣的母亲，元渡的妻子。也是最早接触核心秘密的科学家。
　　　　在京都大学读书时，她是冬月教授的得意门生。虽然冬月教授不甚赞成她的婚事，但却依然在“第二次冲击”后与六分仪元渡结婚，并生下碇真嗣。四年后，在EVA原型机的初次启动实验中，因意外事故而溶化在EVA中。
　　　　日后，在原型机基础上建造而成的初号机体内，埋藏了母亲的灵魂。这也被认为是为什么初号机每每都在关键时刻保护真嗣的原因。
　　　　负责给“碇唯”配音的是林原惠美。
　　　　赤木尚子
　　　　她是赤木律子的母亲，计算机科学相关人士。负责日后成为NERV总部主电脑的超级计算机系统“三贤人”的开发工作。
　　　　她似乎对碇元渡有着超乎寻常的好感，甚至将私人感情带到了工作当中。在MAGI完成的当日，她从绫波丽口中得知，碇元渡只是为了利用她的智慧才与她保持关系。恼羞成怒的她，将外貌酷似碇唯的绫波丽掐死，然后便自杀了。
　　　　“赤木尚子”的配音由土井美加担任。
　　　　基路?洛仑兹
　　　　SEELE最高评议会的议长，相信是德国人。他是“人类补完计划”的最高决策者和NERV的幕后主宰。他出场的时候，通常用“我们”的复数形式来自称，让人感到他只是组织代言者。在整个片子中，他总用护目镜遮住眼睛，似乎没有人知道他的真实身份，是一个被迷雾掩盖的圣徒式人物。从他的出场情况和对白上看，他似乎和冬月教授以及碇元渡似乎有很深的交情。
　　　　为“基路?洛仑兹”配音的是麦人。
　　　　洞木光
　　　　真嗣所在班级的班长，生长在正统家庭，性格比较倔强，相当受班上同学的信赖。同时也是明日香唯一的好友。私底下暗恋着铃原东治。EVA三号机失事后，一直陪伴着受伤的东治。
　　　　为“桐木光”配音的是岩男润子。
　　　　相田剑介
　　　　他是一个典型的都市少年，热衷于武器和摄影，对EVA有很浓厚的兴趣。平日，除了喜欢玩模拟战争游戏之外，也喜欢拿着摄影机去拍摄武器装备。他也是真嗣的同班同学，与铃原东治是一对形影不离的挚交。最大的愿望是能成为EVA的驾驶员，但最终也未能如愿。
　　　　为“相田剑介”配音的是岩永哲哉。
　　　　 剧情梗概
　　　　故事起始于遥远的“圣经时代”……
　　　　根据最为古老的犹太《圣经》记述，被称为第一使徒的亚当与他的第一个妻子第二使徒莉莉斯结合，从而诞生了“魔界之子”路西法。然而，莉莉斯因为不甘臣服于亚当而逃离伊甸园，最终成为了地中海一带作恶多端的“邪恶圣女”。
　　　　然而，上帝耶和华不能宽恕莉莉斯的背叛行为，于是便派天使去捉拿她。但是，莉莉斯与亚当之子，身为第十八使徒和“天使长”的路西法，却违背了神的遗志，试图阻止对莉莉斯的捉拿。因此，路西法成为了“叛神者”，但仍然保持了天使的“美称”，被称为是“堕落天使”。
　　　　上帝被接二连三的背叛激怒，向路西法发出最后的警告，希望他能迷途知返。然而，路西法为了母亲莉莉斯而放弃了忏悔，拒绝“和解”。于是，盛怒的神褫夺了亚当、莉莉斯以及路西法的天使称号。并派出其余的十五个使徒组成“神军”，讨伐叛逆。
　　　　在地中海边，路西法孤身于“神军”展开决战。力量单薄的路西法，在经历了三昼夜的血战之后，最终死在众天使的脚下。同为“神的后裔”，这场路西法与众天使之间的“同族”之战，终于以背叛者的失败而告终。
　　　　而在远方的伊甸园中，亚当和夏娃因为偷吃了“智慧之果”，而触犯了神的禁忌，背负着“原罪”，被赶出了伊甸园。人类从此脱离了神的世界，得以自立。
　　　　千百万年以后，“诺亚时代”来临。此时的人类变得日益堕落，骄横跋扈、不敬神明。为了惩罚人类，神降下“大洪水”，淹没了整个世界。这就是“第一次冲击”。然而，人类毕竟是“神的后裔”，虔诚谦恭的诺亚得到了“神喻”，从而用诺亚方舟保全了家人和尘世上的生灵。人类得以在灾难中幸免。
　　　　在此后的岁月里，人类开始创造自己的文明。在千百年之后，获得了以前被认为只能属于神的“魔手术”，人类则称其为“科学”。
　　　　1999年，当人们为“千禧年”的到来而欢呼雀跃的时候，任教于京都大学的冬月幸增教授与碇唯相识。不久之后，碇唯将自己的男友六分仪元渡介绍给冬月教授。据说，元渡正在借与唯交往的机会，试图接触她背后的神秘组织SEELE。
　　　　日，神的惩罚终于再次降临了。在南极大陆上，发生了一起不明原因的巨大灾变，而在此之前没有任何征兆。这场巨大的浩劫，造成海平面剧烈上升、地轴扭曲、地磁场不规则扰动。不明来历的灰尘遮盖天空，造成全球性气温下降。经济崩溃、民族纷争、内战……其结果是世界人口急速减少，只剩下原来的一半。南极成为了宁静的死寂地域。这是人类在“诺亚时代”之后，经历的最重大浩劫。史称“第二次冲击”。然而，人类终究是智慧生命，重建工作在短暂的混乱之后，逐步展开。
　　　　2001年，故事的主角碇真嗣诞生。而且，此后被授命驾驶EVA的人，也都在这一年出生。这被认为是“EVA”众多谜团中，并不显眼的一个。
　　　　2002年，元渡和冬月为了调查第二次浩劫的起因前往南极。联合国正式发表公告，宣称日的世界规模的大灾害，是由于有超光速数倍的大质量陨石冲击南极大陆所导致，其破坏性相当于6000万年前的地球与小行星的撞击。
　　　　事实上，稍有科学常识的人都能够轻而易举的戳穿这个并不严密的谎言。但是，一切有关“真相”的质疑和猜测，都被严格限制在小范围内。不过，现实毕竟难以掩盖。在相关人士圈内，流传着一些保留下来的照片。在冲击造成的光影中，有一个巨人般的影像。也有些幸存者声称，曾经见到在冲击浪的中心，有数对巨大的翅膀。 其实，“第二次冲击”完全是人类自己造成的。前面提到过，亚当作为“人类的始祖”，其真正的身份是第一使徒。人类曾经在不经意之间捡到了亚当的身体。然而，作为“神”的亚当是不应该留在人间的。但是，人类——或者说是少数几个知道事实真相的“精英”，却要逆天行事。于是，当第二使徒莉莉斯来到人间要找回亚当时，人类不得以引发了“第二次冲击”，这才将莉莉斯的躯体封印在十字架上。但是，莉莉斯却把另外15个使徒的“核”散播到世界各处，为的是等他们长大以后夺回亚当。就这样，已经恢复到卵状态的亚当，以及莉莉斯被封印的身体，都被留在了人间。
　　　　一年以后，即2003年，联合国最终完成对南极的调查。根据调查结果，在位于富士山脚下的箱根，建立了人工进化研究所。而此时元渡已经成为这个研究所的重要人物，冬月教授也在探访了人工进化研究所后，加入了这个组织。此后，在人工进化研究所的基础上逐渐形成了日后使徒与EVA的主战场——第三新东京市。
　　　　2004年，用来对抗使徒的人形兵器EVA的实验型号完成，随后进行了启动实验。然而，首次试验以失败而告终。主动担任驾驶员的碇唯在事故中丧生，而碇真嗣碰巧目睹了整个事故的全过程，心灵受到极大的伤害。自从经历丧妻之痛以后，碇真嗣的父亲元渡便开始将工作的重心转向更为隐秘的“人类补完计划”。
　　　　2010年，日后成为NERV的中枢电脑“三贤人”系统完工。当日，系统的主要开发者赤木尚子神秘自杀。人工进化研究所经过重组，成为了新的秘密特殊任务组织NERV。
　　　　2015年，决定人类未来命运的时刻终于到来了。同样是在毫无征兆的前提下，巨大的不明生物体开始突击第三新东京市。而“敌人”的真实身份都是第三使徒，他的到来是为了把留在NERV总部地底深处的亚当和莉莉斯带回神的世界。面对使徒的攻击，盟军的抵抗显得软弱无力。而此时此刻，在已封锁的街道上，有一位彷徨的少年——他会成为拯救世界的英雄吗？？
　　　　徘徊在街道上的这个少年，就是已经14岁的碇真嗣。此时的他，正在按照父亲来信中的吩咐寻找NERV的作战部长葛城美里。可是，由于使徒来袭，第三新东京市的通讯全部中断，真嗣无论如何也联络不到美里。另一方面，葛城也正在驾车寻找真嗣的下落。就在真嗣准备暂时先去防空洞避难的时候，大地却突然开始振颤。远方，随着盟军空中武装机队的败退，使徒的巨大身影，第一次出现在真嗣的面前。
　　　　在NERV总部，已经分别成为NERV正、副司令官的碇元渡和冬月幸增，正在密切的注意着战事的发展。战斗的激烈程度超出了任何人的想象，常规战法在拥有“绝对领域”的使徒面前根本就是无能为力。最终，总部不得不采取具有巨大破坏力的N2地雷，进行近乎“自杀”的疯狂作战。然而，即使如此也仅仅是稍微延缓了使徒进攻的脚步。面对如此的局面，盟军统帅部不得不按照约定，将与使徒作战的全权委托给碇元渡负责的NERV。
　　　　就在使徒暂停攻击的短暂时间里，葛城带着在战场上巧遇的碇真嗣回到位于第三新东京是地下的NERV总部。而此时，真嗣最想见到的人就是已经久违了的父亲——他们已经有将近三年没有见面了。在前往基地核心区的途中，方向感不佳的葛城迷了路，不得不求助于技手术开发部门的首席科学家赤木律子。在律子和美里的陪同下，真嗣第一次见到了EVA初号机。
　　　　就在真嗣目瞪口呆的面对EVA的时候，一种似曾相识的感觉油然而生。哪知道，真嗣的父亲元渡却突然出现在众人的面前。久别之后的重逢，却没有任何的欢乐和寒暄。元渡只是命令真嗣乘上EVA，去和近在咫尺的使徒搏杀。当真嗣得知这才是父亲将自己找来的唯一原因时，伤心而悲愤的他断然拒绝了父亲的命令。而真嗣的拒绝早在父亲的预料之中。随着使徒的逐渐逼近，碇元渡召唤出在前次实验中身受重伤的绫波丽，命令她代替真嗣出战。面对抱着纱布且还在输血的绫波，真嗣受到极大的震撼，终于答应乘坐EVA出战。
　　　　准备就绪的初号机被巨大的传输系统运送到地面。在夕阳的最后一缕余辉中，初次作战的EVA与来袭的使徒正面相对。在葛城和赤木的指挥下，真嗣操纵着EVA迈出了第一步，但是当他试图继续前进的时候，却不自觉的摔倒了。面对狂奔而来的使徒，恐惧占据了真嗣的全部心灵。随之而来的是使徒一连串的猛烈攻击。初号机的手臂和头部受到严重的损坏，陷入瘫痪状态，驾驶员真嗣也陷入了无意识状态。就在大多数人都认为作战失败的时候，遭到重创的EVA初号机却不明原因突然陷入“暴走”状态，用近乎“虐杀”的方式，突破使徒赖以防御的“绝对领域”，逼迫使徒以“自爆”方式与之同归于尽。烟尘散尽后，人们看到的是几乎完好无缺的EVA初号机。面对如此情景，NERV总部的大部分成员都震惊不已。战斗结束后，几乎没有受伤的真嗣被送进了医院，接受短期的观察治疗。而清理战场和维修初号机的工作也在有条不紊的展开。
　　　　在完成了预定工作之后，葛城美里来到医院接真嗣出院。当美里得知NERV安排真嗣独自居住的时候，感到非常的不安。于是，葛城要求将真嗣带回自己的住处同住，并获得了高层的首肯。自此以后，真嗣就寄住在了葛城家，而葛城美里也顺理成章地做了真嗣的监护人。不过，与其说葛城收留了真嗣，倒不如说是不善家务的葛城给自己找了一个“保姆”。从此，因为长期独居而擅长家务的真嗣便“承包”了葛城家的所有家务。
　　　　在葛城家住下以后，真嗣也开始了自己在第三新东京市的生活，与另一位已知的EVA驾驶员绫波丽在同一间学校学习。每天除去普通的课程之外，真嗣还必须到NERV接受EVA的操纵训练，以期尽快熟练的掌握操作技巧。对于被强加的生活方式，真嗣显得异常消极，身为作战部长的葛城美里和技手术总监赤木律子都对真嗣的状态感到忧心忡忡。
　　　　在学校里的生活，也不尽如人意。虽然已经上了两个星期的课，但是真嗣的移动电话却从没使用过——这意味着他还是没有交到一个朋友。不过，当同班同学发现“碇真嗣就是巨大战斗机器人的驾驶员”时，他马上成为人们注目的焦点。
　　　　下课之后，真嗣被同班同学铃原东治痛打了一顿。原来，东治的妹妹在上次战斗中无辜受伤，铃原将妹妹的受伤规罪于驾驶员的失误，并为此耿耿于怀。被打倒在地的真嗣无助的躺在地上。这时，绫波丽突然出现在真嗣的面前，向他传达了“紧急召集”的命令。第四使徒已经如约而来。
　　　　使徒的进攻警报，弥漫在整个城市上空，第三新东京市进入全面警戒状态。真嗣的同学们都在防空洞内集中，这其中也包括铃原东治和“武器迷”相田剑介。在相田的怂恿下，铃原同相田一起离开防空洞，希望能够见到与使徒作战的真实场景。
　　　　面对使徒的攻击，真嗣驾驶的EVA初号机出动了。可是训练中操练的战法，并没有在实战中给真嗣带来任何帮助。面对疯狂进攻的使徒，真嗣选择了逃避，但这并没有给他带来什么好处，反而让他陷入了更大的危机中。使徒利用自己“光带”式的长臂，将初号机重重的甩在远处的山丘上。而这时，真嗣和指挥作战的NERV总部都发现了正在此处“观战”的铃原和相田。这个突如其来的变故，让真嗣陷入两难的境地。出于本能，他操纵初号机试图保护两个人。与此同时，负责指挥作战的葛城指示真嗣让两人进入驾驶舱。这个决定遭到了律子的反对，但是葛城还是设法说服了律子，“收容”命令得以执行。
　　　　可是，由于驾驶舱里多出了两个人，EVA的神经操纵系统受到干扰，作战效能剧烈降低。可是使徒的攻击却没有减弱。随着时间的流逝，EVA的能量几乎耗尽，败阵似乎已成定局。就在这千钧一发之际，孤注一掷得真嗣拔出高震动粒子刀，奋力刺向使徒。这奋力的一击终于击破了使徒的“绝对领域”。战斗在最后一刻结束了。
　　　　战斗结束之后，葛城对真嗣不服从命令的举动非常不满，大声的斥责真嗣。真嗣却若无其事的表示：除了自己无人能够驾驶EVA，所以他将继续这个工作。由自卑到自负，其实是一个相同的心理动机在左右着真嗣。
　　　　事后，铃原对自己先前无理殴打真嗣感到非常愧疚。他从相田那里得到了真嗣的手机号码，便想打电话过去道歉，然而真嗣的电话却无人应答。真嗣到底怎么了？？原来，真嗣在经历了多重打击之后，完全丧失了继续留下来的信心。于是，便决定离家出走。就在葛城美里准备前去寻找真嗣的时候，铃原和相田却出现在葛城家门口，原来他们是特意前来登门拜访真嗣的。出于职业的敏感，美里对他们隐瞒了真嗣失踪的消息。
　　　　出走的真嗣乘车来到遥远的山村，从翠绿的高山上远望城市，真嗣的心情多少有些改善。傍晚时分，真嗣无意中遇到了正在独自玩“打仗”的相田。在“营地”，相田说很羡慕真嗣能够驾驶EVA与使徒作战，真嗣却希望相田不要尝试那种生活。转天早上，NERV保安部的特工找到了“营地”并带走了真嗣。
　　　　在NERV的禁闭室，真嗣见到了葛城。葛城问他是否要放弃。真嗣回答说，自己虽然不愿意，但是却不想拖累别人，因此会继续留下。这种回答让葛城非常失望，她郑重其事的告诉真嗣：如果决定放弃，就马上离开，回到以前的生活中去。
　　　　在车站，真嗣见到了前来送行的铃原东治和相田剑介。铃原要真嗣将自己打过他的那一拳打还给他，真嗣照做了，两个人之间的隔膜就此烟消云散。铃原和相田向真嗣保证，他们决不允许有人说真嗣的坏话。此后，真嗣被NERV的特工强行带走。
　　　　当列车缓缓开动的时候，葛城美里驾车感到车站。目送着原去的列车，葛城感到了些许无奈。就在他准备离开的时候，她突然发现真嗣正站在对面的月台上。真嗣没有逃走，他留下来了。
　　　　时间回到第三使徒来袭前的几周，由绫波丽驾驶的EVA零号机在接受测试时意外失控，绫波丽乘坐的机舱被从EVA中弹出。这次事故几乎让绫波丽丧命。多亏在场的碇元渡忍住被烫伤的剧痛打开机舱的封盖，才救下了绫波丽。在这个过程中，元渡的眼镜摔坏了。
　　　　这天，葛城美里和碇真嗣来到存放使徒“遗体”的秘密基地。在这里，赤木律子向他们说明了对使徒研究的初步结果。虽然对使徒的了解还非常有限，但是却还是有一个惊人的发现：在使徒的身上又超过99.98%的DNA与人类相同。
　　　　恰巧，真嗣的父亲碇元渡和冬月副司令也来到了这里。真嗣注意到父亲手上的烧伤痕迹。赤木告诉他，那是先前为了救助绫波丽而造成的。
　　　　回到学校之后，真嗣开始注意绫波丽的一举一动。这甚至招来了其他人的误会。真嗣从铃原和相田的口中得知，比自己更早转学来的绫波丽，一直以来都是沉默寡言、不苟言笑。然而，在一次例行的测试实验中，真嗣无意中发觉了绫波里的另一面。当她面对自己的父亲碇元渡时，就会显露出难得一见的灿烂笑容。真嗣为此困惑不已。
　　　　晚上，葛城邀请赤木博士来家里就餐。然而，葛城的厨艺的确是差强人意，搞得所有人都没了胃口。餐后，律子取出了绫波丽的新通行证，拜托真嗣转交。真嗣为此来到了绫波丽的寓所。因为按了很长时间的门铃都无人应声，真嗣便小心翼翼的走进了绫波丽的房间。不想，却让他发现了一副破损的眼镜，真嗣满腹狐疑的戴上了它。就在此时，他突然听到门声，回头却见绫波丽站在身后。眼见绫波丽愤怒的走上前来，真嗣乱了章法，毛手毛脚的扑倒了绫波丽。其实，绫波丽的本意只想取回那副眼镜。更加紧张的真嗣，努力向绫波丽表明自己的清白和无心。而绫波丽却显得无所谓，收好眼镜之后，便自顾自的离开了寓所。
　　　　两个人先后抵达了总部。绫波丽因为旧证件失效而无法进入总部，这时候，真嗣赶上来递过去新证件，绫波丽则毫无表情的接在手里。在前往实验场的途中，真嗣问绫波丽对于即将进行的实验是否害怕。而绫波却反问真嗣为什么怀疑自己父亲的能力。激动的真嗣开始发泄对于自己父亲的不满，可换来的是绫波一个响亮的耳光。
　　　　零号机再次启动实验取得了成功。与此同时，第五使徒已经悄无声息的出现在了人们的视野中。为了迎战使徒，真嗣驾驶初号机再度出击。但是，由于对新使徒的战手术缺乏研究，首战失利，初号机败阵，真嗣身受重伤，常规作战计划被迫取消。得手后的使徒伸出巨大而坚固的钻头，开始突击NERV位于地下都市的总部。即使是最坚固的装甲板，充其量也只能延缓使徒的攻击。NERV若想在此次战斗中获胜必须有依赖新战手术。
　　　　在充分的了解了使徒的特点后，葛城提出了一个大胆的作战计划，即以EVA专用阳电子炮进行定点突击，以强力摧毁使徒的“绝对领域”置其于死地。为此，两架EVA必须配合作战，同时此次作战所需的电力需要由全日本的电力系统供给。对于整个计划而言，真嗣的态度是最大的变数，但是绫波丽的表现却让真嗣最终选择了接受命运。
　　　　战斗准备正在有条不紊的进行着，踏着夕阳的余辉，两架EVA背负着希望出动了。当午夜钟声响起的时候，被命名为“屋岛作战计划”的行动正式开始。谁知，就在真嗣扣动班机的时候，使徒也发动了攻击。在两股阳电子流相遇的一霎那，由于物理效应而导致偏差，首次攻击失败。与此同时，使徒的钻头突破了最后的防护装甲，侵入地下城内。葛城下令进行第二次发射。而使徒的攻击却没有丝毫的停歇。危急时刻，负责防御的零号机以特制盾牌抵挡住了使徒的物理打击，为第二次发射争取了时间。就在零号机的防守行将崩溃前，真嗣再次扣动班机——第五使徒被消灭。
　　　　战斗结束后，真嗣的拼命将载有绫波丽的机舱从遭受重创的零号机中取出，不顾一切的亲手打开机舱封盖救出绫波丽。面对真嗣，绫波丽说：“我不知道该如何面对你？？”真嗣回答：“微笑就可以了。”
　　　　然而，EVA的使命不仅仅是与使徒对决。某日，葛城和赤木应邀出席了日本重化学工业联合体主办的新型JA核动力无人驾驶陆战机器人的发布会。JA的设计者宣称研制这款机器人的目的是为了代替EVA，并且对赤木律子提出“可靠性”的问题不屑一顾。不过，事实胜于雄辩。JA的初次试验就发生了意外。此时的JA犹如一枚行走的核弹。面对如此紧迫的局面，真嗣驾驶初号机紧急出动，将葛城送入了JA机器人的内部。葛城冒着生命危险，赶在内置反应堆爆炸前，关闭了机器人的动力系统。危机解除了。
　　　　盟军太平洋舰队奉命运载由NERV德国支部负责制造的EVA二号机及其驾驶员，前往日本本土。葛城美里带着真嗣、铃原和相田一同前往迎接。在舰队的旗舰上，他们见到了来自德国的二号机驾驶员明日香。而葛城也意外的发现，昔日的男友加持良智也在船上。原来，加持这次表面上是护送明日香和二号机去日本，实际上还负责运送第一使徒亚当到NERV总部。不想，第六使徒突然从水下发动攻势，企图夺回亚当并摧毁EVA。二号机紧急出动，展开水下作战。最终，在付出了太平洋舰队几乎全军覆没的代价之后，EVA以“舰炮狙击”战手术击破使徒的绝对领域。几天后，已经在德国完成大学学业的明日香，以高中生的身份转入了真嗣和绫波丽所在的学校。
　　　　如同往常一样，第七使徒也悄无声息的向第三新东京市袭来。鉴于此前历次作战对于城市的巨大破坏。此次，EVA初号机与二号机联手作战，试图在使徒登陆前将其消灭。可惜，由于战手术失当和配合不力，EVA初战失利，不得不再度使用N2地雷暂时延缓使徒的进攻。因为第七使徒拥有“一分为二”的本领，所以战斗成败的关键也就在于两架EVA能否分毫不差的协同作战。为此，葛城美里选择了一首长度为62秒的乐曲，要求真嗣和明日香以音乐节拍为基准练习协同作战。可是，两人最初的配合，根本就找不到默契。明日香将责任完全推给真嗣，葛城便让绫波丽代替明日香，结果非常成功。自尊心极强的明日香不愿认输，于是便努力的练习，终于达到了作战要求。当使徒恢复行动能力的时候，两架EVA同步展开“62秒作战”，成功的歼灭使徒。
　　　　在经历了多次的防御作战后，NERV试图采取更加主动的作战方式，并且成功的找到了尚未发育成熟的第八使徒。NERV决定派出经过特别改装的二号机，希望能够完整的俘获位于地下1200米处熔岩层中的使徒幼体。但是，当明日香戴着被俘获的使徒返回地面的时候，使徒突然觉醒，二号机被迫仓促迎战。好在真嗣驾驶的初号机及时援手，这才化险为夷。
　　　　数日后的一天，NERV总部的三套供电系统同时发生故障，基地在失去能源供给的情况下，陷入瘫痪状态。包括碇元渡在内的高层人物都怀疑这是一次蓄意破坏。果然，在NERV毫无防备的状况下，第九使徒迅速袭来。危急时刻，NERV被迫决定以手动方式发射EVA。这是三架EVA的首次协同作战。然而，当他们还在垂直通道中行进时，却遭到了来自使徒的强酸攻击。为此，三架EVA重新分配任务，一举摧毁了蜘蛛状的第九使徒。
　　　　由于在作战指挥中的出色表现，葛城美里得到了晋升。可是，她对此似乎并不感到兴奋。让他永远无法忘记的是胸前那道清晰的伤痕。15年前，当“第二次冲击”发生的时候，美里的父亲拼尽全力救出了女儿，自己却不幸罹难。葛城是为了复仇才加入NERV的。由于正、副司令官身负秘密使命前往南极，葛城成为了NERV的最高作战长官。
　　　　硕大无比的第十使徒悄无声息的出现在印度洋上空，紧接着便向地球表面投下一连串威力巨大的“航弹”，而它本身就是一个威力更大的“炸弹”。很明显，它的目的在于从空中完全摧毁NERV和EVA。要么撤退，要么决战，葛城选择了后者，虽然好友赤木律子质疑她的动机，但是葛城已经下定了决心。这是一场速度与默契的较量，除非做到“完美”，否则决无胜算。结果，EVA没有让任何人失望——他们再次获胜而归。
　　　　“三贤人”系统是具有人性化操作界面的超级计算机。按照它的开发者赤木尚子的说法，组成它的三个人性逻辑模型，分别是“母亲”、“女人”和“科学家”。它是NERV的主脑和心脏，也是律子母亲赤木尚子的杰作。然而，在一次例行实验中，系统外围蛋白质壁上的一块并不显眼的腐蚀斑，却不明原因的迅速扩散。当防御装置试图用激光阻止它们扩散时，却遭遇了“绝对领域”。原来，这就是类细菌态的第十一使徒。
　　　　使徒的目的非常明确：侵入并控制“三贤人”系统，进而诱发整个基地的自爆。虽然通过注入化学制剂的手段，曾经一度阻挡住了使徒的进攻。但是，使徒作为微生物的强大适应力，却还是占了上风，一道道防线不断地被突破，胜负似乎已经只是时间的问题了。关键时刻，赤木以改变电脑逻辑程序的方法争取到了两个小时的时间。在了解了使徒的攻击原理之后，赤木决定诱敌深入，在最后一秒钟瓦解了使徒的进攻，NERV转危为安。
　　　　自从第十一使徒被击溃之后，NERV和第三新东京市迎来了难得的平静。但是，对于使徒的来袭，以及那个神秘的“人类补完计划”，所有知情者都守口如瓶。谜团的背后是否隐藏着阴谋？？而希望又在何方？？人们只能拭目以待。
　　　　周日，真嗣、明日香和葛城美里三人都离家赴约。真嗣出行的目的是为了拜祭母亲，同时与父亲碇元渡见面。明日香是受了好友桐木光的邀请，盛情难却。葛城则是为了参加同事的婚礼。
　　　　婚宴上，放荡不羁的加持良智姗姗来迟，这让葛城多少有些不快。其实，加持良智与葛城美里、赤木律子，都曾经就读于第二新东京大学。三人之间的关系也颇为暧昧，葛城还曾经与加持同居，但后来因为葛城执意加入NERV，两人才分手。数年后的重逢，让两人都深感意外。宴会结束后，三人又去酒吧叙旧。葛城喝得酩酊大醉，加持送她回家。途中，葛城向加持吐露了内心的苦闷。
　　　　转天，当加持准备潜入NERV的绝密核心区域“最终教条”的时候，葛城从背后用枪顶住了他的脑袋。原来，加持良智表面上是NERV特别监察部门的职员，暗地里却是日本政府内务省调查部的间谍。然而，当加持打开“最终教条”的铁门时，出现在二人面前的是被封印在十字架上的“亚当”，这难道就是答案吗？？
　　　　真嗣作为EVA驾驶员的表现越来越好，而且还超过了向来自负的明日香。明日香对这样的结果非常的不满，对周围的人牢骚满腹。就在真嗣渐渐树立起自信心的时候，第十二使徒出现在第三新东京市，新的战斗已经无可避免。
　　　　第十二使徒与以往的使徒有很大的区别，浮动在空中的巨大球状物，只是它用来自我伪装的影子，而球状物底下看似阴影的部分才是使徒的实体。由于不明底细，真嗣落入了使徒的陷阱，被困在使徒体内的名为“格拉古之海”的虚度空间里。随着时间的流逝，EVA初号机的动力即将耗尽，真嗣也面临着生命危险。可是，初号机在能量耗尽的情况下，再次非常规重新启动，一举从内部摧毁了使徒。
　　　　由赤木律子负责的技手术开发部门正在紧锣密鼓的开发一种能够使EVA在无人状态下照常工作的设备。这一技手术后来被证明是EVA量产型研发的基础。而传说中的“第四适格者”也渐渐浮出水面。在基地的休息区，真嗣意外的遇到了加持先生。加持带真嗣到自己栽种的瓜田是“参观”，并且给了真嗣许多的鼓励，这让真嗣对加持的看法有了很大的改观。
　　　　或许没有人会想到，原本并不起眼的铃原东治以“第四适格者”的身份成为了从NERV美国支部转移来的EVA三号机驾驶员。在此之前，同样由美国负责建造的EVA四号机，在实验中发生意外，整个NERV美国支部也因此而毁灭。
　　　　当EVA三号机的首次启动实验开始后不久，潜伏在三号机体内的第十三使徒突然出现，三号机失控，松代实验场被摧毁。由于葛城不在基地，碇元渡直接指挥EVA出战。可是真嗣因为不愿伤害三号机内的驾驶员，拒绝执行进攻命令。碇元渡便命令启动尚处于试验阶段的“Dummy System”，这是初号机首次在无人驾驶状态下作战。结果，EVA三号机与第十三使徒同归于尽。铃原虽然侥幸生还，但却身受重伤。好在，体贴的桐木光一直陪伴在他的身边。
　　　　目睹了自己的好友铃原被初号机所伤，真嗣受到了极大的刺激。他竟然操纵EVA攻击碇元渡。但却被轻易制服。根据NERV的条例，真嗣的行为已经构成了严重的犯罪。真嗣本人也当面向父亲表示不愿在驾驶EVA。但是，真嗣真的会就此离开吗？？
　　　　就在真嗣准备乘车离开第三新东京市的时候，警报再次响起。空前强大的第十四使徒，在初号机处于空置的状态下来犯，并