试述基因组序列图绘制原理理是什么

简述双脱氧链终止法测定DNA碱基序列的原理根据下列图谱给出被测定链的基因序列和方向。

正常的体外合成体系中DNA聚合酶在引物的引导下,沿模板链的3’→5’方向移动利用体系中的4种2’-脱氧核...
提取正常组织和A基因过度表达的组织的mRNA进行差减杂交。
不同物种中对64种密码子的使用频率有较大的差异称为遗傳密码子偏好;很少使用的密码子在细胞中其相应的tRNA就很少;如果基因的...
用HindⅢ和EcoRⅠ或KpnⅠ切割A质粒和B质粒,把切割片段重组连接后转化大腸杆菌筛选出具有氨苄青霉素抗性和卡那霉素抗性的克隆...

原标题:【干货】第三代测序技術&原理

从1977年第一代DNA测序技术(Sanger法)发展至今三十多年时间,测序技术已取得了相当大的发展从第一代到第三代乃至第四代,测序读长從长到短再从短到长。虽然就当前形势看来第二代短读长测序技术在全球测序市场上仍然占有着绝对的优势位置但第三和第四代测序技术也已在这一两年的时间中快速发展着。测序技术的每一次变革也都对基因组研究,疾病医疗研究药物研发,育种等领域产生巨大嘚推动作用在这里我主要对当前的测序技术以及它们的测序原理做一个简单的小结。

图1:测序技术的发展历程

生命体遗传信息的快速获嘚对于生命科学的研究有着十分重要的意义以上(图1)所描述的是自沃森和克里克在1953年建立DNA双螺旋结构以来,整个测序技术的发展历程

第一代DNA测序技术用的是1975年由桑格(Sanger)和考尔森(Coulson)开创的链终止法或者是年由马克西姆(Maxam)和吉尔伯特(Gilbert)发明的化学法(链降解)。并在1977年桑格测定了第一个基因组序列,是噬菌体X174的全长5375个碱基1。自此人类获得了窥探生命遗传差异本质的能力,并以此为开端步入基因组学時代研究人员在Sanger法的多年实践之中不断对其进行改进。在2001年完成的首个人类基因组图谱就是以改进了的Sanger法为其测序基础,Sanger法核心原理昰:由于ddNTP的2’和3’都不含羟基其在DNA的合成过程中不能形成磷酸二酯键,因此可以用来中断DNA合成反应在4个 DNA 合成反应体系中分别加入一定仳例带有放射性同位素标记的 ddNTP (分为:ddATP,ddCTP,ddGTP和ddTTP),通过凝胶电泳和放射自显影后可以根据电泳带的位置确定待测分子的DNA序列(图2)这个网址為sanger测序法制作了一个小短片,形象而生动

值得注意的是,就在测序技术起步发展的这一时期中除了Sanger法之外还出现了一些其他的测序技術,如焦磷酸测序法、链接酶法等其中,焦磷酸测序法是后来Roche公司454技术所使用的测序方法2–4而连接酶测序法是后来ABI公司SOLID技术使用的测序方法2,4,但他们的共同核心手段都是利用了Sanger1中的可中断DNA合成反应的dNTP

总的说来,第一代测序技术的主要特点是测序读长可达1000bp准确性高达),我们将立即进行删除处理所有文章仅代表作者观点,不代表本站立场

二十三章?? 基因组学与医学 【测试題】? 一、名词解释 1.HGP 2.基因组 3.基因组学 4.结构基因组学 5.功能基因组学 6.比较基因组学 7.环境基因组学 8.药物基因组学 9.转录组 10.蛋白质组 11.肿瘤基因组解剖工程 12.物理图 13.遗传图 14.SNPs 15.单基因病 16.多基因病 17.获得性基因病     18.____________ 、 21.如果一个碱基位置发生的变异在1%以上的人群存在这个位点就被定义为______位点。 22.通过苼物信息学对基因进行同源性比较分析的主要工具是______ 23.用于蛋白质组学的技术有______? ______? ______。 24.遗传图又称?????? 是指确定标志位点在一条染色体上的线性排列顺序。标志位点间的图距以??????? 距离表示单位为????????? ?? 、?????????????????? 和?????????????????? 。     A 30.关于基因组的叙述不正确的是: ??? A.代表个体所有遗传性状的总和 B.代表一个细胞所有染色体的总和 C.代表一个物种的所有DNA分子的总和 D.代表一个细胞所有蛋白质的总和 E.人类基因组由约30亿对核苷酸的DNA分子构成 31.有关人类基因组計划的不正确叙述是: A.1990年正式启动人类基因组计划 ??? B.全部基因组序列精确图谱已于2000年提前完成 ??? C.遗传图分析、物理图分析及DNA测序等是主要研究內容 ??? D.发展了取样、收集、数据的储存及分析技术 ??? E.目前已建成的数据库包括Genbank,EMBL,DDBJ等 32.后基因组时代研究内容不包括: A.功能基因组学 B.蛋白质组学 C.蛋白質空间结构的分析与预测 D.STS序列分析 E.基因表达产物的功能分析 33.HGP提供的资料错误的是: A.多态性探针资料? B.STS资料?? C.克隆资料?? D.ETS资料?? E.限制性片段资料 34.根據部分基因组序列分析,两个个体之间(双胞胎除外)大约每多少碱基就有一个碱基差异: A.5-10?? B.50-100?? C.500-1000?? D.?? E. 35.在人类基因组计划正式启动前已完成全序列測定的是: A.EB病毒?? B.酿酒酵母?? C.金银线虫?? D.大肠杆菌??? E.果蝇 B型题 (36~40) A.结构基因组学? B.功能基因组学? C.比较基因组学? D.环境基因组学 ?E.药物基因组学 36.研究目的为了解環境对人类疾病的影响和意义的是 37.认识、分析整个基因组所包含的基因、非基因序列及其功能是 38.比较不同物种的整个基因组,增强对各个基因组功能及其发育相关性的认识是 39.完成整个基因组的遗传制图、物理制图及DNA测序的是 40.分析多种候选药物对疾病相关基因和基因产物的潜茬影响发掘新药,设计个性化治疗方案的是 (41~45) A.SSCP? B. ASO? C.DGGE? D.SNP?? E. RFLP

我要回帖

更多关于 基因组序列图绘制原理 的文章

 

随机推荐