御史林润曾弹劾过严世蕃的党羽担心严世蕃卷土重来后会对自己报复,就与谏官商议要告发严世蕃的其他罪行其中涉及到冤杀兵部郎中杨继盛等。严世蕃听到这个消息后很高兴,与自己的亲信说:“不用怕我们这个案子马上就会平反。”司法机关把对严世蕃案的判词告诉了大学士徐阶徐阶问:“你们是想救他活命吗?”大家都说:“就是想要置他于死地”徐阶说:“像这样的判决词奏上去,只会救他一命杀杨继盛一案,严嵩已经经过皇上同意现在把它写上去,只是暴露了皇上的过错就这样上奏,那各位就会大难临头而严世蕃则会太平无事。”于是徐階亲自为他们改动草稿只弹劾严世蕃以南昌仓地有帝王气,就夺过来修造府第式样模仿皇宫。又交通亡命之徒准备向外投靠日本,並派爪牙由山海卫北逃以招诱外族军队里应外合。徐阶改定后当天就让司法机关抄好上奏
严世蕃听说后惊恐地说:“这回死期到了!”果然皇帝批复将严世蕃在闹市斩首。没收其家产抄出的黄金有三万多两,白银二百多万两其他珍奇异宝又价值数百万两。